106年度本縣在全國動物保護業務績效評鑑及動物收容及管制業務評鑑分別榮獲進步獎及表現優秀獎，非六都縣市僅本縣與屏東、苗栗同時在兩項評鑑均獲獎。
縣府指出，農委會每年度都會進行2項全國動物保護評鑑，分別針對：「動物保護業務績效評鑑」及「動物收容及管制業務評鑑」，並依成績訂定特優、優等、甲等、進步獎等等。而這2項動保評鑑主要目的是行政業務的督導，並透過評鑑結果達到鼓勵地方縣市重視動保業務。評鑑除了委託專家進行實地訪查加以評分外，亦須提供有根據的數據資料加以評比。
縣府表示，動物保護業務績效評鑑項目列有6大項：「寵物登記績效、寵物業管理績效、執法及行政績效、犬貓絕育績效、業務創新方案、及實驗動物人道管理行政作為」，其中業務創新方案為加分項目，需要各縣市自行舉證、再由專家獨立審核。106年度本縣寵物登記872隻、辦理寵物登記稽查2,902頭次、針對棄養動物及疏縱動物合計裁罰2件、犬貓絕育947隻，成效均較往年進步。
另動物收容及管制業務評鑑則分為4大項：「動物收容行政資源、收容所管理、動物管制業務管理、業務創新項目」，其中最特別的就是在收容所管理項目中，還會委外請專門機構進行「專案訪查」，也就是會不定期、不事前告知地突擊檢查。
此外，只要有不當收容管理或不當捕犬案例，經查屬實都會直接扣15分，相當嚴格。106年度本縣計推廣認領養139頭、收容所所內死亡率降低至4.62％及參與全國家犬絕育比賽第一階段榮獲全國第三名，第二階段金城鎮公所榮獲非六都組鄉鎮績優獎、提高家犬（貓）絕育補助經費至30萬元，減少不當繁殖。