約莫自103年底，小三通物流便出現了卡關問題，經過了一段時間的陳情、整飭與調整，目前雖有回溫現象，但已難回往日榮景；就產業而言，小三通物流應已進入「常態性」的低迷，放眼未來，我們似乎也應就小三通產業鏈有一番重新的探討及省思。
事實上，陸方一再強調並未終止小三通，只是為了完備行政手續而改變作法；我方希望大陸協助解決小三通貨物卡關的問題有其歷史背景，而且小三通對兩岸互動有很大貢獻，希望能在制度化、合理化、透明化情況下延續，也盼陸方顧及中小企業權益與需求。對此，大陸國台辦表示，近年來台灣業者小三通違規的問題頻頻發生，不僅違規通關，甚至有走私、毒品、槍枝等問題，因此從去年底福建海關展開整治，目的也是為了打擊非法，保護合法；當然也不排除存在一些本來從事合法貿易的企業，看到當局在整頓後，放慢經由小三通往來。而這些所謂規範化的整頓已實質衝擊了小三通的未來，或許我們更應將小三通貨物「常規化」的問題視為福建自貿區上路的一環；與其計較管制嚴格，不如去思考如何導引業者走上正軌，不再去踫觸灰色地帶。金門自經區，以及和福建自貿區的合作及聯動，仍然是我們要持續努力的目標。
的確，有許多人非常看好金門之於兩岸商務的未來，特別是在電子商務這塊。君不見大陸「淘寶網」已大肆登陸台灣並呈現暴衝式的成長，如若金門能搶食這塊大餅，成為兩岸的物流交換站或轉運點，或許也能賦予小三通物流更瑰麗的明天。就技術面而言，此番論點自有其可行性，然而實務上，其障礙似乎在我方的條件不備，而非彼岸願不願意的問題。眾所周知，電子商務無疑是未來商務發展的走向及重點，但在金門恐怕存在一個最大的障礙，便是物流的簡便性及成本；金門擁有兩岸的優勢區位不假，對接陸方物流也確有其便利性，但金門的港埠建設、對台物流的簡便性跟不上，卻也是不爭的事實。諸如：目前台灣雅虎奇摩等主要購物網，尚將金門排除在直送物流網外，當然，主要原因還是市場規模問題；縱金門有小三通物流的優勢，但如果我們的基礎建設始終跟不上，恐怕再多的希望及願景也都是「畫大餅」。
行政院張善政院長於3月9日視察金門建設時，陳縣長特別向他建議，「金門將面對更多的兩岸交流事務，移民署等相關單位人力不足問題，應以正面的思維來面對；因為，政府只有一個，應該站在『國門』的角度，彰顯『國門』應有的規格和高度，縣府也願意在預算上支持。」這個建議獲得張院長正面、即時的回應，特別指示水頭港區已是非常正式的「國門」，未來將以此概念從制度面逐一思考，比照基隆及高雄港作法與機制建設金門。大哉斯言，我們非常慶幸行政院終於了解到了金門「有國門之實，卻無國門規制」的窒礙，此或也是金門機場、碼頭的服務總是跟不上實務需求的主因。
然而，政權更迭在即，此究屬「臨別秋波」，抑或有政策的延續性，雖然是只要路選對了，再遙遠都會達到目的，但契機稍縱即逝，中央實在應該儘早給金門一個明快的決斷及說明！