國立金門農工職校，落實各式教育活動，以樂觀、和諧、進取之精神，營造快樂、活潑、健康的友善校園，榮獲「九十五年度友善校園學生事務及輔導工作績優學校」殊榮。

國立金門農工職校由校長陳水芳召集各處室主任、教師代表、輔導教師等九員，成立工作執行小組，由上而下推展學校各項友善校園業務，除了藉由國際性賽事的參與，擴展學生的國際視野外，也培養德、智、體、群、美等智能，並由老師帶領學生從事環保、社區服務等工作，讓學生在良好的校園環境中，多元、適性學習。

金門農工職校表示，在學校友善校園學生事務與輔導工作中，輔導知能研習、認輔制度及個案研討、小團體輔導、弱勢族群學生教育輔導、人權法治教育、性別平等教育、生命教育、生涯發展教育、親職教育、輔導網絡等要項，並且定期召開友善校園學生事務與輔導工作會議，每學期開會一次：收集友善校園主題相關知能文章供全校教師參考，也從鼓勵學生參加國際性活動開始，拓展學生國際視野。

另外，也藉由各類活動的參與，協助學生加強人權與法治教育、推動品德教育，強化美育教育，包括增強「一校一樂團」措施，聘請校外專家授課；鼓勵「一人一技藝」輔導新生學習樂器或舞蹈。並且長期於學校推展性別平等教育，藉由影片欣賞做為溝通，讓同學於性別平等教育有更深一層的認識。

而學校也特別重視親職教育，除每學年定期全面性家庭訪問外，另安排不定期重點家庭訪問，加強導師與家長之聯繫，溝通對學生管教的理念與方式，以對學生作最適當的輔導，對經常曠課之學生適時通知家長、導師、輔導老師共同會談，研商如何因應解決學生之問題。

學校鼓勵師長建立e化教學平台，提供學生多元學習，讓學習成效與教學更活潑化，此外，學校也重視學生的體健發展，每年的校運會創意化妝遊行比賽，讓同學展現創意；在春暉專案中加強校園安全、無菸環境等宣導教育，並以實際行動進行餐食教育，以「走動式」管理，指導學生飯餘、碗、盤分類，推行垃圾減量，學生用餐情形明顯改善。