由於迭有鄉親反映，航空公司未依既定航班飛行而改飛宗教包機，造成往來台金的不便，對於這種片面取消定期航班的行為，縣長李炷烽相當不以為然，特別於縣府擴大主管會報中，要求相關業管單位應加以重視，並積極督促改善，以維護、確保鄉親行的權益。

縣府表示，國內飛航台金航線各航空公司，長期以來時有將原公告之既定航班取消變更為包機情況，影響搭機旅客權益，經向各航空公司函查九十六年一至六月份取消原公告航班變更為包機情形，各航空公司函覆變更班次數據如下：

(一)華信航空：台北｜金門，18班次；台中｜金門，9班次，合計27班次(1月份2班、2月份3班、3月份4班、4月份7班、5月份9班、6月份2班)。

(二)復興航空：台北｜金門，28班次；高雄｜金門，14班次，合計42班次(1月份4班、2月份1班、3月份10班、4月份8班、5月份10班、6月份9班)。

(三)立榮航空：台北｜金門，8班次；台中｜金門，15班次；嘉義｜金門，3班次；台南｜金門，2班次；高雄｜金門，3班次，合計31班次(1月份1班、2月份無班機變更、3月份5班、 4月份10班、5月份8班、6月份7班)。

(四)遠東航空：台北｜金門，4班次(僅3、4、5、6月份各變更1班)。

縣府指出，就各航空公司函覆資料以觀，各航空公司將原公告之既定航班變更為包機情形極為嚴重，顯已違反民用航空運輸業管理規則第十八條第三項：「民用航空運輸業申請飛航國內包機不得影響定期航線班機之營運」。尤以復興、立榮及華信航空為甚，影響往來台金旅客搭機權益至鉅。

交通旅遊局長林振查表示，對於航空公司的這種取消作法，因該局對航空公司無權管轄，只能發函透過民航局出面解決，督促航空公司改善，除要求不能將定期航班變更為包機使用，也必需依照既定班表飛行，以確保地區鄉親行的權益。

林振查說，經過協調，最近已比較少接到民眾這方面的抱怨，他強調，該局會持續觀察，也呼籲民眾爾後如果再度碰到，先向航空公司反映，未能有效改善的話，可再向縣府反映處理，以約束航空公司。

縣府消保官顏水坤則建議，函請交通部民航局嚴加督導各航空公司，確實依照經該局核准公告之既定班次飛航，以維護往來台金旅客搭機權益。另外，他除了於相關消保會議中反映外，也認為，主要的關鍵在於目前「民用航空運輸業管理規則」第二十一條，只規定航空公司，「因故取消已核准之定期班機，應事先向有關航空站報備」，由於只須報備，而不必經民航局核准，就可取消已核准之定期班機，因此，對航空公司約束力不足。

顏水坤主張，為有效改善這一問題，應再次建請交通部民航局，將「民用航空運輸業管理規則」第二十一條第二款規定，修正為「除天候之不可抗力因素取消已核准之定期班機，得事先向有關航空站報備外；餘因故欲取消已核准之定期班機者，應報請主管機關核准後始得為之」，透過必須經主管機關民航局核准的約束機制，以防範航空公司任意取消既定航班。

目前「民用航空運輸業管理規則」第二十一條條文為：「民用航空運輸業申請國內定期飛航，依下列規定辦理：

一、定期飛航班機時間表，應於生效二十日前報請民航局核准，如有變更時，應於生效五工作日前報請民航局核准。

二、因故取消已核准之定期班機，應事先向有關航空站報備。」

事實上，為解決該問題，縣府消保官顏水坤稍早前即已將問題反映給民航局，促請改善，也曾前往金門民航站，反映問題，釐清真相。

據顏水坤瞭解，目前各航空公司有時會因天候因素、飛機調度，而發生班機取消情形，航空公司強調，班機臨時取消並非因為宗教直航包機緣故，如果民眾有訂位，會在三天前告知，若臨時取消，則會安排訂位旅客轉搭其他航空公司飛機，而宗教直航團體須搭乘包機，不能搭乘一般正常航班，一般旅客也不能乘坐該包機，這是陸委會所規定。

後經顏水坤電話詢問民航局，民航局也說明表示，航空公司若臨時性取消班機，航空公司要填具取消報告單給當地航空站，且一個月內臨時取消的班機數，不能超過當月百分之二十的班次，如果超過，民航局將會予以處分。若是計畫性取消，航空公司則需要先報經民航局核准。