議會秘書長翁自保針對水頭港旅客服務中心預算2.2億案提出說明。（詹宗翰攝）

針對「水頭港大型旅客服務中心新建工程」預算遭議會凍結乙事，金門縣港務處於去年十二月二十九日在官方粉絲專頁貼文表示：「議會以本案工程目前進入司法調查程序，再次提案凍結本案追加預算2.2億元」為由，指出將有後續效應。對此金門縣議會發佈新聞稿指出，基於行政與立法機關間良性互動考量，對議會審議預算案所作之決議事項，理應本於尊重立場，但議會也指出，行政機關亦應在符合憲法與預算法及相關法律規定下，由各機關就決議內容以適法、適當方式加以處理，本案若會造成這樣的後續效應，那是港務處不「依法行政」的結果，議會表示對於本案暨該處不合理展延工期，不排除移請監察院調查，追究相關人員責任。
議會表示，「水頭港大型旅客服務中心新建工程」之預算屬跨年度延續性之資本支出建設計畫，並經議會審議通過109年預算暨中程資本支出計畫，經費總需求計26億3,226萬9,000元，計畫期間自103年1月1日起至111年12月31日止，並非新興資本支出或新增科目，而係屬已獲授權之原訂計畫支出，110年之預算雖遭凍結，或110年第二次追加、減預算未通過，在地方制度法第40條或預算法第54條已有調節因應規定，港務處自應權衡輕重，做適法之處置，依法行政，豈可以議會凍結預算為由，推卸行政怠惰之責任，並將此歸責於議會？
議會指出，對議會審議預算案所作之決議事項，應由各機關就決議內容以適法、適當方式加以處理，自無推託全以一句「尊重議會」之託詞，而不積極審視決議內容之法律效果，採取適法、適當方式處理，讓人不得不質疑港務處不「依法行政」之目的何在？不無行政怠惰之嫌？或是別有動機？則此不依約繼續支付工程款之責任應歸責於行政機關。