H7N9禽流感疫情已在長三角華東地區蔓延擴散，依據4月5日兩岸疫情最新通報資料，江蘇、安徽、浙江等地已發現16件確診病例，其中有六人死亡、目前死亡率為38%，高於嚴重急性呼吸道症候群(SARS)發病高峰期的11%，中國大陸各級政府如臨大敵，正全力追查源頭，在可能疫區內撲殺禽鳥，期盼這次禽流感疫情能在危機聲中被有效控制住。但若隨著各地疫情加速蔓延擴散，情勢越來越有不可收拾之際，啟動疫情危機處理相關機制，恐怕是立即且必須採取的因應措施。
2003年SARS在兩岸蔓延時，當年在金門鄉親與縣議會強力要求下，評估當時防檢疫能力皆不足，小三通曾一度被迫關閉，當時小三通入出境人數才不過是十六餘萬人次而已。如今小三通已逼近一百五十萬人次，水頭碼頭更是兩岸民眾入出境大陸地區、台灣地區的重要通道，人流數量僅次於桃園國際機場，因此落實小三通防疫檢疫工作必須嚴肅以對，更須劍及履及，如何危機總動員與嚴格把關，避免在離島金門傳染擴散，中央衛生署防疫局責無旁貸，必須負起責任。
依照風險管理的標準作業程序，必須設立先兆指標，當傳染圈擴散到福建或廈門時，例如發現禽鳥與人類的傳染案例，就可能進一步擴散，透過小三通入境。原本面對疫情傳染，金門應與廈門通力合作，資訊共享，全力抑制病毒流行擴散。事實上，金門大學去年曾經針對金廈防疫檢疫合作進行考察研究，發現兩岸地方政府間的合作與信息交換機制尚未建立，基礎較薄弱，令人十分憂慮，亟待補強，而中央政府資源能否及時介入救援，包括人員進駐、物資協助，也欠缺事前的純熟演練與標準作業化。
這次H7N9原是禽傳禽的傳染，防疫重點原只是禽鳥疾病的監測、預防與控制，現在進入第二階段的禽傳人以及有限度的人傳人，防檢疫的重點就著重在減少人類的暴露，以及發現及隔離人類病例。一旦進入廣泛的人傳人的第三階段，就必須要有保證醫療服務才能延緩傳播，換言之，必須要有H7N9抗體疫苗問世才能阻止傳染。
金門以觀光立縣，小三通人流物流對金門繁榮發展至關重要，一旦大陸疫情衝破防疫線，對金門傷害將遠遠超過SARS，對台灣而言也是重要防疫線的失守。為了做好萬全準備，以及近日金門年度盛事迎城隍活動的即將來到，應先主動邀請中央CIQS（移民署、衛生署、海關、署立金門醫院）駐金單位，事先演練，一方面彰顯已有萬全準備，安定人心，另方面要求中央政府強化金門小三通防疫檢疫的重要性，不容失守。