自從開啟小三通，連接金門與廈門相互通航以來，迄今已達八年之久，兩門之間已經逐漸形成共同生活圈。金門與廈門及福建之間的緊密關係，正在穩步上升中，為開拓兩門間美好及良性互動關係，金門縣政府的組織架構中，亟須建置一專責單位─「大陸事務局」，以統籌對應大陸凡百事務。其設立之必要性，猶如中央政府之「大陸事務委員會」。
「大陸事務委員會」係大陸政策的制訂者，而「海峽交流基金會」則為大陸政策的執行者，而且，海基會是財團法人組織，即俗稱的白手套角色。「金門縣政府大陸事務局」雖然並非大陸政策的執行者，卻是金門縣政府中新興的功能部門，而且功能吃重，將近於首席之局，甚至，可考慮由副縣長來兼領局務。
國內可借鏡的機構有陸委會，國外可參考的機構則有韓國對朝鮮的國土統一部門，德國統一前西德對東德的聯邦統一部門，都是該國政府中角色吃重的機構。
反觀大陸的涉台事務機構中，中央政府有「國務院對台辦」，各地方政府有省市區對台辦；福建省、泉州市、廈門市、漳州市均有對台辦，甚至，漳州市下屬的龍海市，也有龍海市對台辦。除了各級政府中專屬對台辦單位之外，還有配置相對應的人民團體，如福建省金門同胞聯誼會，泉州市、廈門市、漳州市均有金門同胞聯誼會。由此可見，兩門之間及兩岸之間的互動關係密切而且非常重要，台灣各縣市雖然尚未設立對應大陸事務之專責機構，然而，金門立於前沿陣地之位置，實有必要及早設立對應大陸事務之專責機構。該機購對外面向大陸事務，對內協調及聯繫各有關單位，如社會局、文化局、教育局、旅遊局、衛生局、警察局、海巡岸巡、海關及移民署等等。