針對本縣生物醫療廢棄物管理現況，環保局日前在一項工作報告中強調，本縣達列管門檻之醫療機構僅有1家衛生福利部金門醫院，而非列管有產出生物醫療廢棄物之醫療診所共有49家，其分佈大多聚集於金城鎮。
至於這些醫療廢棄物的數量及流向，據衛福部金門醫院提供的數據顯示，該院於104年1~2月所產出之生物醫療廢棄物(C-05)共產出5.2583公噸，主要產出廢棄物為感染性廢棄物混合物(C-0599)計2.5883公噸、透析廢棄物(C-0508)計1.69公噸。目前這些廢棄物主要委託兩正環保科技有限公司進行清除，最後送至台中達闊友力股份有限公司進行處理。另外49家非列管之醫療診所，其醫療廢棄物亦是委託兩正環保科技有限公司進行清除，最後送至達闊友力股份有限公司進行處理。
而為強化管制作為，本年度迄今，環保局已針對衛生福利部金門醫院及49家非列管之醫療診所執行醫療機構定期輔導稽查作業計10件次。另外也督促要建立完善通報機制，以利第一時間派員處理，掌握現況。在派員監督清除機構至本縣事業清運醫療廢棄物之過程中，也將確認清運機具為「空車」，查詢車輛GPS軌跡，以避免類似之情事再度發生。
再者，環保局重申，對醫療機構進行定期輔導稽查作業，將持續加強比對清除、處理機構每月提報之清運聯單，以勾稽本縣醫療機構申報資料是否確實，並確認其醫療廢棄物依規定交付清除處理。