金門地區火龍果栽培面積漸廣，病蟲害發生亦漸趨嚴重，其病害多藉雨水傳播，農試所特別提醒農友，夏日雨後應儘速修剪清園，預防病害的發生、確保果實收成。
　農試所表示，火龍果以往一向被認為病蟲害少，且種植容易，種植後的隔年即可順利「開枝結果」，快速得到收益，因此獲得農友栽植的興趣大增。不過，紅龍果病害除病毒病之外，主要以炭疽病、莖潰瘍病等真菌性病害最為嚴重，危害枝條果實造成斑點、腐爛、樹勢衰弱，病原菌於雨季藉雨水傳播感染並影響果實外觀及品質，降低商品價值。
　火龍果近來還出現一種新發生病害—真菌性潰瘍病，大量且摧毀性地入侵紅龍果果園，罹病枝條出現斑點或莖肉潰爛，罹病果實輕微者出現斑點影響賣相，發病嚴重者則會結痂成塊斑或果實發育不良、深受潰瘍病影響之苦。
　目前防治紅龍果潰瘍病的方法已獲得研究成果，農友利用4-4式波爾多液可抑制紅龍果潰瘍病菌的菌絲生長與孢子發芽，達到殺菌與預防發病效果。其枝條生長養護期的黃金防治時機更見成效，因為新生枝條開始萌出生長，非常適合病原菌拓展感染。除趁機移除病害枝條降低感染源外，更要保護新生枝條不受感染。
　農試所表示，波爾多液屬於無機鹽類藥劑，有種植火龍果的農友們可先施用一次4-4式波爾多液，殺死罹病組織上的病菌，避免後續清園時病原飄散，同時提供新生枝條一層防護層；待七到十天後徹底剪除罹病枝條，並掩埋或移出田間；部份龍果產區發現果實於綠果時表皮提早轉色，切開有果皮增厚，維管束褐化的現象，當果實成熟時罹病部位果皮顏色較深，且易有裂果現象，經鑑定為細菌性病害，為火龍果細菌性果斑病。農試所強調，病害防治不能只靠防治資材，除配合選擇健康種苗建立良好的開始外，若果園已有病害發生，應大刀闊斧砍除病枝以降低病原量，確保作物收成。