水源一直以來就是金門發展的隱憂，而此一難題不只發生在金門，全球各地皆然，所以許多先進或已獲得成功的經驗足以提供我們學習。最容易理解的莫如：「主要的污染源來自人類活動所造成的！」減少污水進入河川、水源地肯定是保留乾淨水質的不二法門。
長期從事金門環境監測的田野調查人士，在接近金門少數僅有的河川時，最怵目驚心的就是發現河川上漂浮著各種垃圾、建築廢棄物等。金門人因為天性使然，很少有機會靠近這些「稀有」的水源區，但隨著開放之後，許多來自外地的工作者因為金門缺乏遊憩的地方，所以這些區域突然之間成了這批人的遊樂天堂。但同樣的，隨地丟棄垃圾的惡習亦嚴重的污染了這些金門珍貴的水源。
過去幾年，金門縣政府已經針對家用污水進行處理，使得來自家庭的污水直接流入河川的情形獲得了很大的改善。既然政府已經用心解決部分的問題，剩餘的其他問題更需儘速處理。正所謂的「為山九仞、功虧一簣」，我們必須把握民氣重視環境及水源的潮流，挖掘造成水質污染的問題，提出有效的改善計畫，才能達到真正的「正本清源」。
河川不僅僅是人類生活的命脈，也是許多金門珍貴原生物種(如：水獺)的家，旅客任意進入危及牠們的生存與族群繁衍，不能不察。在台灣許多高山，甚至市區的小溪、河道附近的居民，已經意識到河川之於人的重要性，於是「護溪、封溪」的運動四起。但是在金門，民眾很難感受到「溪流」的存在，此堪為金門環境保育的潛在危機！
金門縣堪稱為溪流較大者有：斗門溪、光前溪、田埔溪、山外溪，其次則是小溝渠類：董林溪、中蘭溪、平林溪、後嚨溪、西山水庫上游、同安渡口上鳳尾溝，以及許多不知名的小溝渠等。金門或許沒有大山大水，但山丘崗陵、涓滴細流卻也造就了金門之所以有海上仙洲的美譽！這些區域是許多年近百歲老人家們的記憶，他們年幼時曾經走過、待過這些「乾淨」的溪流，並工作、嬉戲其中。這些區域中有許多地方因為長年軍事管制的關係所以人煙罕至，在撤軍之後成了環境及治安的死角！
過去島上的居民水源直接取自河川或是山井，民眾與水源是親密接觸的關係，所以河川自然而然在自己的日常生活中。但是現代社會中，我們的用水來自於一個小小的「水龍頭」，所以水源可說是雲深不知處，所以很難有所感。然而，或許是因為這「無心」之過，島民的危機就潛伏其中。水源保育運動、通報系統都是目前金門所缺乏的！讓金門河川「流入」民眾的心，從此時此刻起就是政府與民眾共同努力的方向！