金門日報前身為正氣中華報，緣始創於民國37年初的國軍18軍所發行於遂平的無邪報，後遷徐陽發行，同年底停刊，至民國38年春胡璉將軍在江西南城，乃將18軍的無邪報正式更名為正氣中華報，作為教育訓練之用，後因時局動盪，輾轉南遷來金，又復遷台北，同年11月25日報社遷金復刊，社址設於水頭「酉堂」，過三個月即遷後浦，直到民國51年10月17日再遷成功村現址迄今。 

初始仍以正氣中華報發行，及至民國54年10月31日金門日報創刊後兩報並行，民國80年5月啟用電腦排版系統，民國81年9月「新訊樓」落成啟用，11月7日終止戰地政務，金門日報社改隸金門縣政府，發行金門日報，正氣中華報由金防部接手以週刊形制發行，民國88年7月1日本報第一、四版正式改為彩色印刷，民國95年10月引進四色印刷機，同年12月1日五、八版亦改為彩印版。

由於網際網路之興起，本社於民國90年自行架設網站，並於90年1月27日上線，提供網站新聞，邁入資訊時代的里程碑，於民國105年5月4日開辦電子報紙免費提供下載閱讀瀏灠，進入全版電子報紙的新時代，又於民國109年3月23日開辦「即時新聞」提供鄉親即時之重大新聞訊息。

本縣實施戰地政務時期，鑑於地區酒箱、酒盒、貼花紙等印製需要，並抑止地區人口外流，增加就業機會，於民國65年戰地政務委員會下令成立彩印所，首批彩色紙盒成品於民國66年3月21日正式出廠交貨，後為擴大服務項目並陸續增添平版、貼花、燙金及瓦楞加工等設備加入營運，後由於開放台省自由市場競爭，本社印刷廠營運困難，決定印刷廠停止對外營業，只自行印製報紙之出版任務。