水頭碼頭長距離登船處有一百多公尺，乘客登船時需走一段長路，若遇下雨更是不便，議員提案建議縣府在水頭碼頭興建候船室，以供往來旅客鄉親遮風避雨。縣府指出，水頭碼頭候船環境，配合水頭商港整體規劃作業，目前係興建臨時設施以解決現有問題，預定七月份可完工使用，可提供大小金門旅客候船之用；另浮動碼頭至臨時通關服務中心之間填整作為旅客候船走廊，業由金門港務處辦理招標作業中。

議員洪麗萍、陳玉珍於第三屆第一次定期會提案「請在水頭碼頭興建候船室，以供往來旅客鄉親遮雨避風案。」並有議員陳恩賜、張光海、洪允典、許玉昭、李沃士等位連署。

提案中指出，水頭長堤距離登船處有一百多公尺長，老弱婦孺在登船時需要走一段長路，若是下雨，全身濕透，苦不堪言。

她們表示，建水頭商港是塊大餅，何時動工完成，尚難預料，不要因要建水頭商港而忽略鄉親及旅客之權益。政府應在浮動碼頭右側填海造陸，建造候船室，以讓旅客、鄉親有遮風避雨處。

縣府建設局在回復時指出，縣府對於大小金門之交通與候船空間之改善，因受限於預算故採分年辦理改善，九宮碼頭候船室業已於八十九年完成使用，水頭碼頭候船環境，原係配合水頭商港整體規劃作業，因受限於計畫期程，目前係興建臨時設施以解決現有問題，預定七月份可完工使用，平時即可提供大小金門旅客候船之用；另經向交通部爭取經費將浮動碼頭至臨時通關服務中心之間填整作為旅客候船走廊，業由金門港務處辦理招標作業中。

建設局表示，有關金門水頭商港第一期工程業經行政院核定，刻正依計畫推動中，西防波堤並於九十年辦理發包動工興建，北防波堤及第一座碼頭工程也將在近期辦理招標興建。