有關本次特定區通盤檢討的方向是以都市發展目標的訂定、道路系統檢討、自然村的問題、軍事機關用地、戰地政務時期合法建築的問題、解決原有三個都市計畫套繪錯誤及書圖不符的問題、解決原計畫圖誤差的問題等項。其中道路系統檢討未來道路系統功能兼具觀光功能、生活功能、軍事功能。道路系統變更類型，分為原計畫道路廢除、新增計畫道路、道路寬度變更、道路等級變更等項。

在自然村的問題上，將自然村範圍依據實測地形圖，配合發展現況、自然地形及現有道路檢討修正。並重新修正土地使用管制要點，目前已修正為出容積率百分之六十，最小容積率百分之一百八十，對於自然村之限制將比原計畫放寬且具彈性。

關於軍事機關用地之爭議，建議檢討不需要的基地，配合數值地籍及實測資料套繪於主要計畫圖上，變更無須保留之軍事機關用地。

對於戰地政務時期至民國八十五年合法建築的問題，由於當初建築管理制度與現行制度差異甚大，造成民眾反彈及建築管理的困擾，也希望透過土地使用分區管制，區分出新舊地區的不同，使得新舊地區能相容並序，逐漸以市場的機制達成環境的改造，使得民眾能於無形中適應新的制度。

至於民眾意見彙整有道路系統及路寬修正、都市計畫農業區的開發利用問題、國家公園的限制、私有土地被化為公共設施用地、變更為其他使用分區等及人民陳情案。

對於規劃公司的規劃內容，議員陳恩賜指出，都市計畫關係金門發展，通檢時間太久，希望短期間促其實現，軍事管制區土地應作地毯式的調查，而許多道路通往各景點的規劃都在國家公園範圍內，這問題很大必須設法解套，而對於道路的拓寬，他認為可以容積移轉方式，減少支出，又可達成目的。

議員王再生認為都計通檢時間拖得更久，經濟與商業更形沒落，而商業區、工業區的規劃透過檢討研擬長遠的發展計畫。尤其是道路的規劃要有長遠的發展眼光，自然村原有風貌按原有去發展。並加強景觀維護，而規劃的內容必須將國家公園管制的範圍套入。

議員陳玉珍則認為未來道路的規劃應實地訪查，原計畫如涉及國家公園部分協調問題，尤應重視。

議員許玉昭指出，台省各縣市都市計畫委員會當地之軍管司令都是當然委員，地區都市計畫委員軍方代表層級太低。她也希望傳統聚落的保存，是否可採容積移轉方式，以達到保存的目的。他也建議高應科大附近應多規劃一些教育用地，以做為該校擴充校舍之用。另對於龍門大鎮中農地規劃是否適當提出質疑。

議員蔡水游認為都市計畫，將許多農業區改劃為風景區，讓許多農民因抵觸中央規定，農民因此喪失農保權益。他認為應透過土地管制要點作修正以照顧農友權益。

議員李沃士指出，本縣都市計畫是朝觀光前提在走，許多有看頭的景點位於國家公園範圍內，但國家公園近年來積極於保護環境與傳統建築聚落，計畫區之道路如在國家範圍內無法去拓寬美化，重要景點無法配合串聯；而與民眾生活面息息相關的「生活面」問題，在規劃方向時應納入，認真思考，掌握大方向作適度修正。他強調都市計畫細部計畫應具有前瞻性並符合民意。

副議長許永鎮表示，金門特定計畫區修訂位階是否凌駕國家公園必須先作釐清，有助於未來推展的方便性，他認為都市計畫通檢應考慮現實性與未來性，當規劃循序漸進美意並到現實問題時，是否能忍住陣痛持續往前行，是現存最大困難。儘量容許民眾聲音納入通檢規劃中，以減少阻礙，讓執行更順利。

對於議員的意見，縣長李炷烽也極為重視，當場也要求規劃公司將意見納入通檢案中，他並表示，將於近期內邀集國家公園與軍方代表就計畫通檢溝通協調，希望能配合。李炷烽也希望顧問公司切忌大而不當的規劃內容，因應未來發展需求，他認為應將觀光客與軍人的數字膨脹些，才有大格局，而公告期間百姓陳情案件儘量以個案來處理配合，他希望大家一起來，彙集各方百姓意見，在規劃初期納入，深入問題，讓金門特定區計畫通盤檢討案能切合地區的發展與民眾需求。