針對縣籍立委吳成典要求軍方同意民眾申請在自然村建築許可時，免辦軍事會勘，對於必須辦軍事會勘的案件，也要簡化流程，一次完成作業，國防部在回覆吳成典時指出，在國安法相關法規未修正前，現階段仍依法令規定辦理，但也責成金防部對於民眾申請案需以最速件處理，二十日內完成回覆。

吳成典指出，金門地區在國共對峙期間，全島幾乎都是軍事管制區，而依據國家安全法及其施行細則規定，民眾於軍事禁、限建範圍內申請建築許可，均需防區司令部同意後始可興建，由於曠日廢時，民怨迭起，對政府行政形象影響甚鉅。

金門縣政府在接獲民眾陳情後，除去函請求金門防衛司令部全力配合民眾申建時程現地會勘外，並請縣籍立委吳成典向國防部反映，研究解決之道，以維護民眾申建權益。

縣長李炷烽及立委吳成典均指出，依據國家安全法第五條規定：「為確保海防及軍事安全，得由國防部會同內政部指定海岸、山地或重要軍事設施地區，劃為管制區，並公告之：：：：為軍事所必須者，得實施限建、禁建；：：：：」其施行細則第四十三條亦規定：「直轄市、縣(市)主管建築機關受理於禁建、限建範圍內之建築執照申請時，應先徵得該管軍事或警察機關同意後始得核發執照：：：：。」地區民眾依規定提出申請時，防區司令部往往需耗時一、二個月之久審核，嚴重耽誤建築時程，影響民眾權益至鉅。

因此，他們建議國防部對金門縣各自然村排除管制(依金門特定區計畫土地使用分區管制規定，自然村內建築以三層樓為限，該範圍內之申建案對軍事防務應無重大影響)，並自九十二年一月起自然村內之申建案，同意免辦理軍事會勘，而由金門縣政府逕予核發建築許可。另對於必須辦理軍事會勘之案件，亦請簡化作業流程，並訂定時效管制規定，且每次會勘時應指派具決策權限之人員到場，一次完成會勘作業；在法定核照時間內，未表達意見者，視同同意辦理。

案經國防部參謀本部作戰及計畫參謀次長室昨(16)日函覆吳成典指出，按國家安全法施行細則第四十三條規定，在法規未修正前，現階段宜依法令規定辦理。而為改善過去申建會勘時程，已責成金門防衛司令部，爾後凡接獲自然村開發案件，必須以最速件之方式處理，十日內辦理現地會勘，二十日完成函復。吳成典除對軍方從善如流表示肯定與感謝外，並請金防部指派專人負責與金門縣政府工務局建立對話窗口，以縮短行政流程，確實維護民眾權益。