金門位於福建省九龍江口，本縣的沿岸漁業與養殖業是否受到九龍江出海口附近的重金屬及有機質明顯增高的影響，根據水試所委託國立中山大學研究之「福建九龍江對金門海域水質、底泥及牡蠣之影響」調查報告指出，金門海域水質符合甲類海域水質標準，其牡蠣亦未受重金屬污染無食用上安全之顧慮。

水試所指出，金門位於福建省九龍江口，其北、西、南海岸有一大片潮間帶，向來為海藻及魚介貝類優良棲息場所，資源豐富，居民從事牡蠣、文蛤、血蚶、紫菜等淺海養殖及漁撈業，而這其中又以牡蠣為最主要的淺海養殖產業。

由於九龍江為福建省第二大江，其每秒平均流量達187立方公尺，其河水據研究指出會流至金門北海岸，鑑於近年廈門經濟特區及海滄工業區迅速發展，使得九龍江出海口附近的重金屬及有機質有明顯增高現象。而邇來台灣有關牡蠣含高量重金屬之報導十分引人注目，且本縣漁民亦反映牡蠣減產及水產動植物資源量銳減問題，為釐清九龍江對金門沿岸漁業及養殖業之影響，金門縣水產試驗所特於九十一年五月委託國立中山大學，由陳鎮東及陳孟仙兩位教授主持，辦理「福建九龍江對金門海域水質、底泥及牡蠣之影響」之研究調查。

水試所所長翁自保指出，該項調查報告業已出爐，依報告內容顯示，在海域水質方面，其生化需氧量(BOD)及金屬含量等，就我國環保署的海域水體分類標準而言，均符合標準。另牡蠣在重金屬含量方面，則未受重金屬污染，無食用上安全之顧慮。因此，以金門乾淨無污染的海域，又有別於台灣獨特的養殖方式｜｜石條式牡蠣，是屬牡蠣中的「土雞」，肉質甘甜鮮美，值得消費者選擇採購。

水試所表示，依中山大學研究報告顯示，九龍江輸出的淡水，應該沒有大量擴及小金門或大金門，但也應考量不同季節及九龍江的水量而定。另九龍江輸出的重金屬大部份在廈門港區沈澱，並無輸送到金門附近的潮間帶。此份水質調查及分析資料有助於釐清金門的牡蠣其生長環境是優良的，並沒有受到九龍江太大的影響。

研究報告也指出，九十一年金門幾處養殖地點，牡蠣大量死亡，以牡蠣體內的重金屬蓄積的濃度來看，並非重金屬污染所致。

不過，水試所也特別指出，此次研究亦針對於九十一年六月蒐集沒入之「大陸走私牡蠣」採樣分析，發現當中所含之鎘(Cd)濃度有明顯偏高之現象，未來大陸走私之牡蠣尤應加強取締，以保障消費者的食用安全。水試所也呼籲民眾不要購買未經檢疫之大陸水產品，以維身體健康。