為瞭解金門地區小三通防疫、檢疫措施運作情形，行政院大陸委員會主任委員蔡英文將於今日上午來金視察。行政院長游錫昨日也指出，金門是否暫時關閉小三通，必須在兼顧國人健康、國家發展、國際觀感及避免引起大陸與國際社會誤解等前提下審慎進行評估，並將在今日做出決定。

累計至昨日為止，台灣地區嚴重急性呼吸道症候群(ＳＡＲＳ)的通報病例已達六十六例，可能病例也有十三例，為避免疫情擴散，與大陸地區試辦小三通的連江縣，府會已於廿八日正式建議陸委會暫時關閉小三通，連江縣長陳雪生昨日也證實，在廿八日的船班開航後，將自四月一日的下一航次起暫時停航。縣長李炷烽亦於廿八日召開記者會，強調「健康第一、生命無價」的前提，但強力要求中央儘速加強防疫與檢疫措施，以有效防杜疫病擴散。李炷烽並表示，一旦廈門也有疫情傳出，不排除採取關閉小三通的非常措施。

行政院長游錫則於昨日接受媒體專訪時指出，ＳＡＲＳ疫情日益猖獗，已造成金馬地區民眾的憂慮，對應否暫時關閉兩岸「小三通」管道，游錫認為，必須在兼顧全民健康、國家發展和國際觀感前提下考量，尤其應極力避免引發中國大陸和國際社會不必要的誤解，政府將在審慎評估後做出決定。

金門與廈門地區的小三通，目前尚未受疫情影響而停航，昨日排定的週日航班，因廈門地區舉辦國際馬拉松賽延至今天開航，為瞭解小三通防疫、檢疫實際作業情形，包括陸委會主委蔡英文、衛生署疾病管制局副局長許國雄等人，今日上午將搭乘早班機來金視察，除訪視金門尚義機場、縣衛生局、縣立醫院等處，也將前往水頭碼頭實地瞭解排定的同安號、鼓浪嶼號船舶進港及旅客入境情形。陸委會在實地訪查與內部檢討後，會將評估結果陳送行政院。

縣長李炷烽昨日再次強調，縣府自小三通啟動以來，不斷強調金門「最前線」防檢疫工作的重要性，也一再要求中央加強各項措施，但似乎未受到中央重視，即便在ＳＡＲＳ疫情發生後，中央駐金單位仍舊「一夫當關」，僅派駐一名疾管局人員負責宣導，對總統陳水扁制定「加強金馬地區(小三通)檢疫防疫計劃」的政策指示，迄今也不見具體作為。

是否應於此時關閉小三通，李炷烽認為，倘若疫情持續告急，連對岸廈門也傳出病例，主管機關自應做出專業判斷，採取斷然措施，以免病毒在兩岸之間交互流通。不過李炷烽也認為，與每天從港澳進出大陸的旅客相較之下，中轉金門的台商只是少數，中央當務之急應從加強金門防檢疫工作著手，不能「採其華而棄其實，識其小而遺其大」，否則未經審慎評估即告中斷小三通，將是捨本逐末的作法。

四月五日清明節向來是中國人返鄉祭祖的重大節慶，小三通實施兩年多來，也一直是台商中轉返鄉的高峰期之一，倘若中央宣布暫時中止小三通，首當其衝的將是這些中轉返鄉的台商。

目前居住在金門地區的福建籍大陸配偶，在小三通管道關閉後，也必須回到起點，彎繞疫情最為嚴重的港澳返鄉。有關大陸人民開放來金旅遊一案，勢必也將受疫情波及而推遲。