為避免SARS疫情進一步擴散蔓延，交通部昨日緊急宣布幾項重要防疫措施，昨日晚間六時起，台金航線飛機旅客，以及金廈航線船班旅客，在搭機、搭船時應自備並全程配戴口罩，大、小金門間航線，也自今(三)日起比照該項規定辦理，未自備口罩者將不得登船、登機。縣府也特別呼籲，為了大家的健康著想，請民眾共同配合。

交通部航政司是在昨日下午以「最速件」方式，傳真該項防疫新措施給各縣市政府及港務處，要求各業管單位確實通知業者，並派員確實督導。空運方面，根據交通部函令規定，搭乘包括台、金等國內航線，或各國際航線班機，除食用餐飲時外，旅客及機組員於機艙內應自備並全程配戴口罩，倘若旅客未自備口罩者，業者得拒絕旅客登機，倘若允許旅客登機，則業者必須提供口罩。該項措施已自昨日晚間六時起正式生效，若旅客經三次勸導仍不遵守規定，航空公司將蒐集相關事證，送請衛生署疾管局駐機場人員開具罰單，並將旅客隔離於機上特定集中區域。

船運方面，分為小三通及大、小金門國內航線，其中小三通的防疫新措施比照空運自昨日晚間六時起生效，大、小金門船班則自今(三)日上午六時起實施。防疫措施的內容同樣比照空運，要求船員與旅客必須自備並全程配戴口罩。

縣府指出，該項措施主要用意在保護搭乘機、船的所有乘客，希望民眾配合，也呼籲承攬小三通航運業務的相關業者，務必提醒旅客從和平碼頭出境開始，就必須自備並全程配戴口罩。此外，交通部也呼籲民眾搭乘其他鐵路、捷運、公車等大眾運輸工具時，也能配戴口罩，以減少感染機會。至於計程車部分，考量旅客人數及乘車時間不長，僅建議旅客配戴口罩，計程車駕駛則因工作時間及環境因素，交通部建議運匠大哥們在執業時能夠戴上口罩，以保護本身及乘客健康。