隨著「春運」的接近，以及包機直航的可能觸礁，已使得金、廈小三通航線更加炙手可熱。對岸廈門為了服務台商，航空業者不但成立「調度小組」，結合兩岸海、空運業者推出「聯票」，提供旅客海陸空聯運服務，有關部門也成立各項服務中心，受理台商的報名、登記、購票的服務。為抓緊台商的心，動作相當積極。

去年首度推出的經停第三地包機直航模式，隨著春節的逐漸逼近，以及兩岸各說各話的局勢演變，觸礁可能性大增，連帶使得金、廈小三通航線益發炙手可熱。大陸方面已準備透過海陸空聯運模式來紓運返鄉台商，福建省台辦副主任韋忠慈日昨亦特別針對春運工作召開記者會，宣布將在廈門成立「台商報名、登記、購票服務中心」，於廈門和平碼頭設置「客運服務中心和一票制聯運中心」，於福州設立「報名、購票服務中心」。廈門航空公司則與我方立榮航空等三家航空公司，以及兩岸四家船運公司簽訂「聯運及服務協定」，將利用廈航的飛航網絡，將「海空聯運」服務擴展至大陸各省。

包括金門縣政府以及縣籍立委吳成典國會辦公室亦曾邀集中央、地方等相關單位，針對春運工作進行協調，縣府及旅行業者也將在水頭碼頭、尚義機場等處設置服務點，協助旅客接駁返鄉，航空公司也同意視旅客人數增開加班機，整個春運工作已蓄勢待發。

行政院大陸委員會則在去年年底針對「九十三年大陸台商春節返鄉專案」召開會議，同意在春運期間將小三通適用對象擴及福建以外地區台商及其眷屬，也已提出申請程序及審核作業須知，透過各種管道轉知台商及相關業者。

廈門方面，廈門航空公司與我方航空、旅遊業者聯合推出「廈航聯運客票」，讓旅客一次購足從出發地至廈門的機票，金廈航線的船票，以及從金門到台灣的機票。只要乘坐廈航(ＭＦ)航班及購買其產品服務的旅客，廈航還將負責承運高崎機場至和平碼頭的旅客及行李運輸工作，倘若因航班銜接出狀況，造成旅客無法正常登船而滯留廈門時，廈航也表示將免費提供宿、行服務。

金廈航線的船班，為因應估計上萬人次的台商旅客，經兩岸航運業者協商後，春運期間將從每週四個航日增加為六個航日，除週四之外每天都有客輪往返金、廈兩門。

為了維護旅客安全，海巡署金門第九海巡隊已派遣巡防艇前往大、二膽海域密集巡弋，執行驅離大陸漁船，並清除航道漁網。縣府則規劃在春運啟動前，在元月六日首次辦理名為「金海一號」的載客船舶海難緊急應變演練。為避免包括ＳＡＲＳ在內的各種疫情，透過頻繁進出的旅客入侵，農委會動植物防疫檢疫局不斷宣導旅客切勿攜帶動植物及其產品入境，春運期間將加派人手加強檢查，衛生署疾病管制局及縣府衛生局也將全力動員在碼頭、機場加強人員檢疫與防疫宣導工作。

該項春節台商小三通輸運工作即將從元月九日啟動，持續到二月二日，前後二十五天期間，估計將有一萬五千名臺商循小三通管道經金門中轉返臺過年。