行政院試辦金馬小三通已逾三年，民調顯示百分之四十五點八的民眾普遍認為對地區經濟發展沒有實際助益，金門縣農會理事長蔡水游認為，地區應建立一套機制讓農產品經檢疫合法進口，才能避免岸際走私猖獗。

金門縣商會理事長許峻岷則表示，要落實阿扁政府拚經濟的政策，應將免營業稅改為「零稅率」，小三通應擴大開放人貨中轉，落實「離島建設條例」，確實照顧離島居民，並建議開放大陸地區民生用品經檢疫後合法進口，對消費者才有保障，地區經濟才有商機。

蔡水游指出，小三通實施三年來，對小規模栽培的菜農衝擊較大，而大陸走私蔬果價格雖低廉，卻有食品衛生安全顧慮，大陸方面甚至增添防腐劑來保鮮，對人體傷害是無形的，地方衛生和防疫單位應加強取締。蔡水游指出，反觀金門地區農友種植的蔬果，用藥皆在安全範圍內，政府應加以保障推廣。

蔡水游說，既然要小三通，政府應建立一套合法機制，輔導蔬果透過正常管道經檢疫合法辦理進口，不能任由岸際走私交易，同時對業者加強輔導產品區隔，讓大家對地區自產的蔬菜吃得安心。

蔡水游表示，畜產業方面同樣因缺乏合法管道造成走私猖獗，不過蔡水游指出，禽流感等疾病不一定要經由走私才能傳染，野鳥也可能是傳播媒介，而金門則是「小三通」這個名詞的受害者。他認為，兩岸距離太近、往來太頻繁，如沒有辦法避免，政府應加強內部控管與消毒，建議縣府應向中央爭取補助加強防疫消毒，地區的畜產業才能獲得保障。

金門縣商會理事長許峻岷指出，去年九月四日阿扁總統抵金時，他曾向阿扁進言，強調地區要落實拚經濟政策，就應開放人貨中轉，若只開放台商所需物品取得證明才能出口，實質意義不大，而台商過境中轉對地區而言，實際受益的相關行業也不多，若能讓所有觀光客皆經金門中轉，並在金門當地消費，這才能帶動地區的經濟。

許峻岷表示，小三通最重要的「加工出口」貨物中轉，一直以來都沒有成功案例，地區需要的民生用品也沒有開放，造成走私小額貿易猖獗，合法商家不能生存，若能透過正常管道讓民生用品進來，並經檢驗、檢疫後在當地消費使用，如此不但對消費者有保障，也能讓合法商家有利潤可圖。

許峻岷提到有關「離島建設條例」時指出，「免關稅」表列開放的三百多個品項，因金門當地市場太小，開放品項根本不符地區需求，同時中央無法導正稅率，由大陸進口貨物，若加上關稅、營業稅等，增加了業者貨物中轉的負擔，讓業者興致缺缺。有關「免營業稅」對地區幫助不大，要改為「零稅率」才能有所助益，也只有小三通擴大人貨中轉，才能落實拚經濟政策。