因應國軍金門醫院精實裁撤案，金門縣立醫院已完成「第二綜合病房區新建工程」規劃，擇定在縣立醫院與台銀金門分行之間，即現有停車場興建乙座五層樓高的急、慢性病房大樓，這項新建工程係由中央及離島建設基金、地方政府配合款合資興建，將在十一月底前發包興建，預定明年底前完竣啟用。

備受矚目關切的國軍金門醫院精實裁撤案，又在衛生署今年五月三十一日的一項會議決議事項中證實，會中決議「國軍金門醫院確立於九十四年四月一日起進行精實裁撤，並停止門、急診及住院等醫療作業：：：：」；面對軍醫裁撤在即，加上籌建「綜合醫療大樓」，經費尚無核定及施工期要長達四年之久，緩不濟急。

縣立醫院決議先行以院內現有之空間，即將縣立醫院與台銀金門分行之間停車場擴建為乙座「第二綜合病房區」，已規劃一樓為急診室；二樓為復健；三樓為洗腎、加護病房；四樓、五樓為急慢性病房，全部總計有八十五床位；至於，地下一層為儲藏室；面積約三千二百七十五平方公尺。

即將在月底前發包的「第二綜合病房區新建工程」，其工程款來自中央、離島建設基金及地方政府配合款，預定明年底前完工，完工後將使縣立醫院現有一百四十一病床增至二百二十六床，以因應國軍金門醫院裁撤後的情勢及醫療需求；國軍金門醫院一旦走入歷史，金門醫療也馬上面臨空前挑戰。