第六屆立法委員選舉投票日為十二月十一日，福建省金門縣選舉委員會指出，本屆立委選舉全縣大、小金門以及烏坵三地總計有四十四個投開票所。

根據選委會相關資料指出，第六屆立法委員選舉各投開票所編號及設置地點如下：

第一投(開)票所：王氏宗祠，東門里一至十五鄰。第二投(開)票所：東門代天府廟前，東門里十六至二十九鄰。第三投(開)票所：西門里辦公處，南門里一至二十四鄰。第四投(開)票所：南門里辦公處，南門里二十五至三十九鄰。第五投(開)票所：中正國小一○一教室，西門里一至二十鄰。第六投(開)票所：中正國小二○七教室，西門里二十一至二十九鄰。第七投(開)票所：中正國小二○一教室(西門里三十至四十鄰)。第八投(開)票所：傅錫琪紀念館，北門里。第九投(開)票所：賢庵里辦公處，賢庵里。第十投(開)票所：金水里辦公處，金水里。第十一投(開)票所：古城里辦公處，古城里。第十二投(開)票所：珠沙里辦公處，珠沙里。

第十三投(開)票所：古寧村辦公處，古寧村。第十四投(開)票所：安美村辦公處，安美村。第十五投(開)票所：湖埔村辦公處，湖埔村。第十六投(開)票所：榜林村辦公處，榜林村。第十七投(開)票所：盤山村辦公處，盤山村。第十八投(開)票所：后盤村辦公處，后盤村。

第十九投開(票)所：新市里辦公處，新市里一至十五鄰。第二十投開(票)所：新市里舊鎮公所，新市里十六至二十九鄰。第二十一投開(票)所：山外里辦公處，山外里。第二十二投(開)票所：溪湖里辦公處，溪湖里。第二十三投開(票)所：蓮庵里辦公處，蓮庵里。第二十四投開(票)所：料羅里辦公處，料羅里。第二十五投(開)票所：新湖里辦公處，新湖里一至十鄰。第二十六投開(票)所：湖前社區活動中心(舊湖前分校)，新湖里十一至二十三鄰。第二十七投開(票)所：正義里辦公處，正義里。第二十八投開(票)所：瓊林里辦公處，瓊林里。

第二十九投開(票)所：金沙國小，汶沙里第一鄰至十三鄰。第三十投開(票)所：汶沙里辦公處，汶沙里第十四鄰至二十七鄰。第三十一投開(票)所：何斗里辦公處，何斗里。第三十二投開(票)所：浦山里辦公處，浦山里。第三十三投開(票)所：西園里辦公處，西園里。第三十四投開(票)所：官嶼里辦公處，官嶼里。第三十五投開(票)所：三山里辦公處，三山里。第三十六投開(票)所：大洋里辦公處，大洋里。第三十七投開(票)所：光前里辦公處，光前里。

第三十八投開(票)所：林湖村辦公處，林湖村。第三十九投開(票)所：黃埔村辦公處，黃埔村。第四十投開(票)所：西口村辦公處，西口村。第四十一投開(票)所：上林村辦公處，上林村。

第四十二投開(票)所：上岐村辦公處，上岐村。第四十三投開(票)所：烏坵鄉公所大廳，大坵村。第四十四投開(票)所：小坵國小，小坵村。

金城地區共設置十二個投開票所為全縣(含烏坵)之冠，其次是金湖以及金沙分別有十個投開票所，金寧共設有六個投開票所、烈嶼設有三個投開票所以及烏坵設有三個投開票所，共計四十四個投開票所。