台閩地區目前唯一保存最完整的三級古蹟前清總兵署衙｜「清金門鎮總兵署」，因法令修訂與新史料出現，金門縣政府業務主管部門經與內政部主管聯繫，並先行召開審查會審議後，將報請內政部重新評定其古蹟價值，並建請提升為國定古蹟的等級，以還原總兵署在歷史意義上的新定位。

金門縣政府民政局、文化局針對金門縣第三級古蹟「清金門鎮總兵署」因法令修訂與新史料出現，經於二月十六日假台北金門服務中心召開古蹟評鑑升等審查會議，出席審查委員有周宗賢、閻亞寧、李乾朗、薛琴、陳建豐等人。

金門縣政府民政局、文化局指出，「清金門鎮總兵署」是於民國八十年十一月二十三日經內政部公告指定為第三級古蹟。該古蹟經八十三年完成調查研究，九十年完成修復，九十三年完成再利用，並於九十三年十月十六日對外開放參觀。

金門縣政府民政局、文化局並指出，清金門鎮總兵署於古蹟指定後，復因文化資產保存法於八十六年修訂，第三十條中增列「文化風貌」亦為保存重點，亦即指定為第三級古蹟之標準應予重新檢討。爰此，中國技術學院建築系副教授閻亞寧撰成「清金門鎮總兵署文化意涵的重新評估」一文，主要重點為：

一、古蹟創建的時間係清軍攻台前夕(康熙二十一年，一六八二年)，原設於舊金城北門外的臨時衙署無法執行公務，而以整體戰略考量遷建總兵署於腹地廣闊的後浦，並奠定了後浦三百餘年間成為金門首治的重要地位，影響至為深遠。

二、遷署之舉與一般認為首任總兵陳龍「艱於子息」而奪許獬叢青軒址之說，顯然有很大差異。復以新發現史料「龍溪縣志」也說明陳龍妻胡氏，對輔佐陳龍治金頗有貢獻，更可充實本古蹟之歷史意涵。

三、清金門鎮總兵署基本格局仍保存完好，符合大清會典的相關規制；兩岸目前皆甚少有類似遺存，具代表性與稀少性。

四、總兵署變遷過程中，五十七年改建頭門，係由傳統工匠在特殊時空下採「不見木」的技術完成，具有反映時代特性的技術史價值。

五、建議該古蹟應重新評定其古蹟價值，並提升為國定古蹟。

周宗賢則在對於總兵署古蹟評鑑升等的審查意見上，認為清金門鎮總兵署在歷史上的意義有新而重大的發現，清初設金門總兵，並自舊金城遷至後浦之際即改變金門鎮總兵之任務與戰略性質，舊金城時期，是面向大陸、面向廈門港；後浦時期，則是面向台灣海峽，以台灣為主要對象，這是金門鎮總兵在歷史意義上的新定位，則其衙署在文化資產意義上，也相對加以加分。且現今第一級古蹟缺清代的衙署，國定古蹟也未列名，比較彰顯之間的評價，清金門鎮總兵署可列名國定古蹟是值得肯定的。

審查委員薛琴則表示，按立法院新通過的「文化資產保存法」第二十七條規定：「古蹟依其主管機關，區分為國定、直轄市定、縣(市)定三類：：：」。明顯的看出來，古蹟定位不再是依等級來訂定，而是依照主管機關來分類。在金門地區目前僅有「第一級古蹟」一處，很顯然在主管機關的配比方面，屈於國定的類型不足。薛琴並指出，文資法新法既已通過，金門地區的古蹟類型宜作通盤的檢討。目前台澎金馬屬於官署的古蹟原本不多，因此「清金門鎮總兵署」的重新評鑑是可行的。此外，在「歷史意義上」或「不見木」的技術工法上，尚有一定的技術價值意義。

閻亞寧則針對「清金門鎮總兵署古蹟文化意涵的重新評估」提出總結，認為價值觀的判斷，往往因著時代變遷而調整，文化資產保存法的歷次修訂，正可充分說明這種現象。清金門鎮總兵署在當時的觀念下僅勉強列為第三級古蹟，即便是經歷調查研究與修復再利用，仍未能就其價值重新予以認知，對這座重要的古蹟誠屬委屈。

閻亞寧並指出，康熙二十一年，金門鎮總兵陳龍基於整體戰略和腹地發展的考量，將總兵署由舊金城移置後浦，開啟了三百年來後浦成為金門首治的地位，總兵官秩正二品，其官署於「大清會典」載有定規，現今古蹟仍保存衙署、治事、辦事與宴息之所的完整格局，具有極重要歷史時證意義。民國五十七年頭門改建，由傳統工匠在社會變遷環境下，發揮巧思，採用傳統與現代結合的「不見木」工法，至今保存完好，具有技術史價值。

閻亞寧並認為，真實性的追求，是近年古蹟保存相當受重視的課題，亦即一座古蹟的價值，除了具象的外在形貌之外，更應深究其內在文化意涵。由是觀之，以現行文資法的評估標準，清金門鎮總兵署的歷史、文化與技術價值，時有重新認知的必要，而其古蹟等級於修復與再利用完成後，亦應再予評估提升，俾能充分且正確的反應這座古蹟豐富的文化意涵。