為讓離島建設基金更合理有效分配，行政院經建會日前已針對九十三年「離島建設基金補助計畫」執行情形與成效進行檢討，該會也建議未來應採「競爭型計畫」逐案審議的模式，由主管機關檢視執行情況，並衡酌經費需求再核撥預算，使基金的運用更有效率。

經建會表示，在檢討「離島建設基金補助計畫」執行情形與成效時，發現離島建設面臨多項重大問題，包括：如何落實永續發展之政策目標？如何使基金之分配利用更合理有效？如何強化計畫之先期作業及配合措施？如何建立計畫之規劃審議作業機制等。

為落實永續發展之政策目標，合理有效分配基金，經建會已研擬「離島建設業務檢討及改進方案」及「促進離島永續發展方針」草案，將於核定後推動實施。

為避免發生計畫核定後，發生規劃設計遲遲無法定案，或是土地未能取得，抑或法令限制等問題，該會也建議未來申請補助時，應提出計畫具體內容及所需之配合措施，以免計畫一再變更，或受上述因素影響而延宕執行、保留預算。

由於離島建設第一期綜合實施方案期程至九十五年底，各縣市已申請辦理第二期方案之委託規劃，為確保建設方向及執行能符合政策目標，經建會也建議各主管部會於縣市政府規劃過程中，主動協助、參與，並於縣市政府提報年度計畫時，進行實質審查及考量執行能力補助經費。

而為避免各部會於推動離島建設時，各行其是，缺乏跨部會整體規劃，經建會認為各計畫之規劃設計，應先送離島建設指導委員會工作小組審查，以強化橫向連繫、確保建設品質，發揮整體效益。

因離島建設補助計畫部分跨年度之延續性計畫，曾發生上年度預算尚未執行，當年度又繼續核撥，致發生預算保留執行情形，經建會也建議未來應採「競爭型計畫」逐案審議模式，由主管機關檢視執行情況，並衡酌經費需求再核撥預算，使基金之運用更有效率。

另外，為確保各建設計畫之執行能符合生態永續原則及利於評估，經建會已會同各主管機關研訂各類計畫績效指標，將邀請學者專家深入研議，並提工作小組確定後，做為未來計畫目標管理及績效檢討之依據。