自從兩岸開放小三通之後，大量大陸物資商品循小額走私途徑進口，形成大陸藥品在金門地區普遍流通的現象，然而因近幾年消費者消費意識抬頭，大多數民眾已知曉用藥需由醫師、藥師指示下方可使用，因此，大體上一般地區民眾對所謂大陸藥品都是看的多、買的少，根據金門縣衛生局近年來稽查成果顯示，市面上已少見大陸藥品蹤跡，偶有零星販售者，也在金門縣衛生局輔導下已下架不再販售。

金門縣衛生局檢驗市售大陸中藥品質，以重金屬含量偏高、中藥摻西藥、標示不完整及不合格為多，均與藥物安全性、有效性之原則相去甚遠，且大陸藥品偽、劣藥不少，加上多數藥廠未實施GMP優良藥品製造規範，品質堪慮，吃出問題也無法求償，民眾用藥還是謹慎為要。

目前政府並未開放大陸藥品進口，無法對大陸產製之藥品進行廣泛的調查。金門縣衛生局為確保消費大眾知的權益，不定期稽查市售大陸食品之標示，並抽樣食品及蔬果送藥物食品檢驗局化驗，及隨時上網更新最新的抽驗結果供消費大眾參考(網址為www.kmhb.gov.tw)，並發佈新聞稿呼籲鄉親勿購買未經進口檢驗把關的走私食品。

金門縣衛生局並針對檢驗不合格的食品，要求販售業者、攤販立即下架，不得再陳列販售。同時並針對散裝食品，要求業者不得包裝販售，若有自行包裝情事，一律要求加貼完整食品標示，否則不得販售。

金門縣衛生局並結合各項活動宣導民眾對大陸藥品的認識，及其對健康的危害。另也定期暨不定期針對地攤及一般商家進行輔導稽查，以杜絕大陸藥品在市面的蹤跡。

金門縣衛生局表示，衛生機關負責末端管理，如何儘快協調一套配套機制，使兩岸的商業行為化暗為明，杜絕標示不全甚至有礙衛生安全的走私食品、藥品四處流竄，使之合法申請透明公開經營商業，謀取利潤，讓中央設在金門的海巡、岸巡、標檢局、疫檢等單位發揮「前置把關」篩檢功能，落實「源頭管理」目標，才能真正達到除罪化的政策與目標。