金門縣民前的鼠疫，造成無數人死亡，在縣民當年「聞鼠色變」同時，隨著國軍進駐，民國四十一年由軍方中央醫學公衛單位成立鼠疫防治處，專責捕鼠、分析及解剖與長期監測印度鼠蚤指數及感染宿主，已充份得到控制，未再發生鼠疫病例。倒是恙蟲病例的增加，深值縣民重視和加強滅鼠作為。

近幾年來，由於生態環境改變及醫技提昇，加上各單位大量滅鼠，致鼠類的指數逐年下降，但相對鼠隻身上的恙蟲指數並未有相對配套，實施藥劑滅恙，致原本寄生在鼠類的恙蟲因鼠隻的死亡而跳出另找寄宿主。

金門縣以農業面積為多，因荒廢土地雜草叢生加上軍方實施精實方案，原本碉堡、半掩體及營舍及操訓空間也變成營造廢土及垃圾場所，衍生鼠輩棲息之處，隨處可見。

恙蟲為離島地區特殊疾病，並非台灣都會可見，金門縣醫療環境特殊，支援、輪調、承作IDS之醫師經常一月一換，致病人偶有症狀就醫，均不容易在第一時間檢查對症治療。

九十四年一月至六月，金門縣衛生局自行監測的佈籠所捕獲的鼠類，所捉到的野外小黃腹鼠分析，幾達百分之百均寄宿有恙蟲，顯見源頭管理之滅鼠及相對滅恙，有待相關單位加強作為，否則金門縣的恙蟲病例還會繼續通報，光靠衛生局宣導及對醫師(事)人員在職教育是不夠的。

金門縣衛生局年度曾巡迴辦理專題演講十二場次，軍中營區恙蟲介紹六場次及鄉鎮清潔伙伴等講習，並委請第四台作字幕跑馬燈宣導，於諸多宣導和研習舉辦，都希望達到「預防重於治療」目的，唯昧於實際需要，如軍方野外操課演習、環境清潔及金門縣農作播種、除草、施肥、採收等，均無法避免與大自然作短距離等接觸，因此，每每從病例疫情調查，不難發現被感染者的蛛絲馬跡。

根據金門縣衛生局統計指出，九十四年一月至九月通報疑似恙蟲病例八十七人，比九十三年三十八人，增加四十九人，成長二點二九倍，軍人五十二人，比去年二十六人，增加二十六人，成長二倍。民眾三十五人，比去年十二人，增加二十三人，成長二點九一倍。而血液檢查培養確診為恙蟲病的患者就有五十二人，比去年二十七人，增加二十五人，成長一點九二倍，軍人三十四人，比去年二十人，增加十四人，成長一點七倍，民眾十八人與去年七人，增加十一人，成長二點五七倍。

金門縣衛生局表示，以本年度七月份通報二十九例，確診二十七例為最多。其中，又以金湖鎮三十人，佔百分之五十八為最高。金沙鎮十二人，佔百分之二十三。金城鎮五人，佔百分之十。金寧鄉三人，佔百分之六。烈嶼鄉二人，佔百分之三。由通報及確診病例來看，金湖鎮是該更加強防疫作為的重點。

另據國防大學醫學院預防醫學研究所九十三年於金門縣調查報告明白表示，該所自九十一年開始在金門實施定點監測分析兩點結論：一、金門鼠類捕獲率已有明顯下降，顯然金門縣滅鼠已具成效。二、在金門捕獲的鼠，很多地區恙蟲寄生率達百分之百，這表示恙蟲在金門的疫情已達警戒線，並呼籲軍民野外活動應特別留意，而各醫療院所醫師及護理人員對發燒病患也應特別留意是否罹患恙蟲病。

由於恙蟲病的正確防治措施，不外乎加強環境衛生、滅鼠及疫情監視，以及加速地區醫師對特殊地區性疾病之認知與通報之時效，使個案能夠「早期發現、早期治療」，回返社區，減少經濟生活負擔。因而，在「髒亂永遠是傳染病的溫床」前提下，金門各鄉鎮徹底消滅病媒、阻絕疫癘當是防患未然之要務，而且是必須而非多餘。行政措施更有賴各相關單位在執行滅鼠之同時，也要考慮鼠隻身上的寄宿病媒(恙蟲、蜱等)有相對的撲滅配套，並共同配合及共同戮力，推展防疫使社區里民免受蟲害，維護縣民健康。