針對「金門縣綜合發展計畫」暨「離島綜合建設實施方案」的規劃研究，受金門縣政府委託的中華綜合發展研究院並對金門產業發展方向提出建議。其中，也建議金門在漁業發展上，可規劃大型休閒海釣場，來擴大觀光資源。

中華綜合發展研究院針對金門產業發展方向所提出的建議，在農業發展方面，建議發展精緻農業或有機花卉；農特產開發利用計畫以台灣、大陸之高消費城市為目標市場；規劃農場集中設置以形成特區，俾利於管理營運及休閒觀光。

有關漁業發展方面，中華綜合發展研究院建議，可朝規劃多功能之休閒漁業與漁港，以成為未來休閒觀光之主題；及規劃大型休閒海釣場，來擴大觀光資源；另外，應輔導漁民第二專長訓練，推動轉型為休閒漁業。

在畜牧業發展方面，中華綜合發展研究院建議，畜產觀光化可規劃小區以供應在地需求為主；畜場宜集中形成特區，便於管理及休閒觀光；並應延續發展畜牧發展及產銷輔導計畫。

至於工業發展方面，中華綜合發展研究院認為，發展在地資源，如陶瓷土可爭取故宮仿清品授權，配合觀光產業，朝精緻收藏品方向發展；而海洋生技產業評估方面，由於現有研究資源不足，風險極高；電子加工業與裝配廠評估上，則難以和對岸競爭價格。

中華綜合發展研究院指出，在商業發展上，金門應朝推動特色產業，在中小企業處地方特色產業輔導計畫著手；另外，提升商業競爭力上，宜朝特色產業發展個案輔導；而加強商業環境改善方面，建議商業司金門形象商圈推廣計畫及商圈人才培育計畫努力；以及輔導縣內特產品廠商申請工業局傳統產業補助經費。

在觀光發展方面，中華綜合發展研究院建議，在大陸福建人士咸認金門缺乏觀光誘因及缺完整套裝行程，為吸引廈門、福建龐大旅遊人口，應全盤整合觀光產業與農林漁牧、生態資源及人文資源；另可朝成立旅遊聯合服務中心，規劃各種套裝行程等服務；以及重新規劃大陸人士來金觀光路線(如廈門｜小金門｜大金門)。

而在文化發展方面，中華綜合發展研究院建議，金門縣政府在建築保存再利用維護計畫上，可朝訂定古蹟修復優先順序，逐年增加遊覽動線；大、二膽等六離島朝生態島嶼或空間博物館推動；並以編纂金門縣志以增強旅外鄉親認同；以及加強兩岸文教交流、推展偏遠離島藝文活動扶植計畫。

有關創意產業發展方面，中華綜合發展研究院建議，配合挑戰2008計劃爭取國際會議在金門召開；並結合資訊建設，發展e化產業。