金門縣政府為處理未立案補習班事件，建立執法之公平性，並提昇公信力，依補習及進修教育法，特訂定有處理未立案補習班裁罰基準，未依法申請核准立案，而以補習班或類似補習班名義擅自招生或開班授課者，第一次查獲後發函命其立即停辦並公告之。第二次查獲除再次發函命其立即停辦外，負責人依裁罰基準處以罰鍰。

金門縣政府經已訂定頒布施行的處理未立案補習班裁罰基準，該基準所稱未立案補習班，係指金門縣轄區內未完成立案手續者，包括「未申請籌設立案」、「已申請籌設立案中」，涉及招生、收費、授課行為且上課人數在三人以上之短期補習教育機構。

至於所稱「未申請籌設立案」，係指尚未至金門縣政府正式遞送申請籌設案件；「已申請籌設立案中」，係指已至金門縣政府送件申請籌設立案中者。

有關未立案補習班事件裁罰基準，金門縣政府指出，未依法申請核准立案，而以補習班或類似補習班名義擅自招生或開班授課者，依據補習及進修教育法第二十四條規定，第一次查獲後發函命其立即停辦並公告之。第二次查獲除再次發函命其立即停辦外，負責人依下列標準處以罰鍰：

一、招收學生總數合計五十人(含)以下並已申請籌設立案中者，處五萬元罰鍰。二、招收學生總數合計五十人(含)以下，未申請籌設立案者，處七萬元罰鍰。三、招收學生總數合計五十一人至一百人(含)，已申請籌設立案中者，處七萬元罰鍰。四、招收學生總數合計五十一人至一百人(含)，未申請籌設立案者，處九萬元罰鍰。五、招收學生總數合計一百零一人以上，已申請籌設立案中者，處十萬元罰鍰。六、招收學生總數合計一百零一人以上，未申請籌設立案者，處十五萬元罰鍰。

金門縣政府指出，經裁處罰鍰處分仍不遵令停辦者，得依前次罰鍰額度每次得增高罰鍰額度二至五萬元，至最高額度二十五萬元止，並按日連續處罰。至於其所使用之器材、設備得沒入。所處罰鍰經限期繳納，屆期仍未繳納者，由金門縣政府移送強制執行。