針對金馬小三通航線營運，交通部昨天公布了營運概況。在進出港旅客為六十七萬人次，比2005年增加百分之二十點五；進出港貨物九十點三萬公噸，比前一年減少百分之四十五，主因是金馬地區進口砂石貨量下降。而單就金門而言，九十五年度進出港旅客為六十二萬三千零八十三人次，比九十四年度的五十一萬八千七百二十八人次，成長了十萬餘人次。

2006年金馬小三通進出港船舶共八千九百三十四艘次，平均每天二十四艘次，比前一年增加百分之四。其中客輪佔百分之七十五點二，貨輪佔百分之二十三點一，其餘為客貨輪。

根據交通部統計處分析，去年金門｜廈門客輪航班增加，加上金門｜泉州定期客輪於2006年六月八日開航，客輪總計增加二千五百三十二艘次，成長率高達百分之六十點五；客貨輪增加六十六艘次居次；貨輪因金馬進口砂石貨量下降，減少二千二百餘艘次，衰退百分之五十二點三。

由於透過金馬小三通旅遊、探親、學術和宗教交流的人數增加，2006年進出港旅客共六十七萬人次，比前一年增加二成，其中台灣旅客五十九萬人次，成長一成三；中國籍旅客僅八萬人。

金馬小三通進出港貨物共九十點三萬公噸，但進、出港貨物量明顯失衡，進港貨物佔了九十點一萬公噸，這當中有近八成五為中國大陸的砂石；出港貨物僅一千七百四十一公噸，主要為酒和貢糖等雜貨以及漁產品。