自從兩岸開放小三通之後，大量大陸物資商品循小額走私途徑進口，曾經形成大陸藥品在金門地區普遍流通之現象，然因近幾年消費者意識抬頭，大多數民眾已知曉用藥需由醫師、藥師指示下方可使用。加上主管機關近年來強力取締，市面上已少見大陸藥品蹤跡，偶有零星販售，皆在主管機關輔導下已下架不再販售。

隨著政府開放大陸探親，海峽兩岸人民往來亦趨頻繁，大陸藥品夾藏入境偶有聽聞，由於現今政府目前尚未開放輸入大陸藥品，因此，不論自行攜帶或藉由其他管道進口之大陸藥品，均未依法送經衛生主管機構審核或辦理查驗登記，從而對其品質即缺乏保證，安全亦值得憂慮，不容縣民掉以輕心而不加留意。

而在衛教宣導方面，金門縣政府相關機關深入地區各角落，辦理大陸藥品問題宣導活動，九十四年度共計辦理二十三場次，九十五年度共計辦理二十七場次。

在稽查方面，衛生局不定期及每季配合菸酒聯合稽查小組成員前往金城鎮、金湖鎮、金沙鎮、金寧鄉、烈嶼鄉各觀光風景區、特產行、商店、菜市場及烈嶼鄉烈女廟、將軍廟等地方加強稽查輔導，並要求陳列大陸藥品者全面下架，不得販售。九十四年度稽查三百六十一家次，九十五年度稽查三百九十六家次。

而為杜絕非法流通中藥販售情形，主管機關也配合行政院衛生署中醫藥委員會(九十四年度不法藥物聯合稽查專案)，共計稽查十二處，違規計十處，均依藥事法輔導改善及處辦。

而在執行(立委曾燦燈指示查核大陸藥品案)方面，係針對中西藥房、攤販、檳榔攤、超市等處稽查非法輸入之大陸西藥與中藥(西瓜霜、雲南白藥)，計四十三家次。

金門縣衛生局指出，將結合各項活動，宣導民眾對大陸藥品之認識及其對健康之危害；並定期暨不定期針對地攤及一般商家進行輔導稽查，以杜絕大陸藥品在市面之蹤跡。而在大陸食品管理方面，由於大陸黑心食品事件報導層出不窮，金門民眾對大陸食品普遍心存戒懼，金門縣衛生局為確保消費大眾知的權益，不定期稽查市售大陸食品之標示，並抽樣食品及蔬果送藥物食品檢驗局化驗，抽驗結果並隨時更新公布於衛生局網站(www.kmhb.gov.tw)。

稽查方面，九十四年抽驗生鮮蔬果農藥殘留二十七件，均符合規定。抽驗南北貨及大陸食品八十三件，十八件不符規定，已要求業者下架，不得販售。九十五年抽驗生鮮蔬果農藥殘留三十件，結果均合格。抽驗大陸食品十三件，其中有一件未符合規定，查市場已無該項產品。

金門縣衛生局指出，為宣導非法大陸食品對健康之危害，將結合各項衛教宣導活動，以提醒消費大眾對大陸食品之認識及其對健康之危害。至於加強取締非法大陸食品方面，則將定期暨不定期針對地攤及一般商家進行輔導稽查，針對檢驗不合格的食品，要求販售業者、攤商立即下架，不得再陳列販售。