根據福建省政府彙整的資料，金門縣與連江縣實施小三通七年來，人員及貨物往來數逐年增加，但仍無法符合民眾實需，省府也將持續積極爭取擴大小三通中轉功能，以符合民眾之期待，增進金馬地區工商業繁榮與發展。

根據省府彙整去年金馬兩縣小三通人員往來、商務貿易的比較：

金門地區小三通人員往來部分，去年金門民眾(含台商)赴大陸人數(單程)計三十一萬九千五百零二人次，較前年的二十七萬八千零六十人次增加四萬一千四百四十二人次，成長百分之十五。而大陸地區民眾來金門人數計四萬五千五百零九人次，較前年的三萬五千三百九十九人次增加一萬零一百一十人次，成長百分之二十九。另大陸地區貨物輸入金門地區計三百八十八航次，貨運砂石等計一百五十八萬五千零九十三公噸。金門地區貨物輸入大陸地區，僅少數金酒等特產計九千三百八十五點九四公噸。

馬祖地區小三通人員往來部分，馬祖民眾(含台商)赴大陸人數計一萬九千一百一十六人次，較前年的一萬六千七百零九人次增加二千四百零七人次，成長百分之十四。而大陸地區民眾來馬祖人數計七千八百一十三人次，較前年的六千五百三十人次，增加一千二百八十三人次，成長百分之二十。

另大陸地區輸入馬祖之貨運水泥、砂石等計一百八十二萬五千三百七十八公噸。

另外，金馬地區兌換人民幣自九十四年十月三日核定截至九十六年十一月份止，其兌換情形分別為：金門地區：核定台銀金門分行、土銀金門分行、土銀金城分行、金門縣金城信用合作社、元大銀行金門分行等五家，計買入人民幣62,341.4千元，賣出357,233.1千元。

馬祖地區：核定台銀馬祖分行一家，計買入人民幣398.4千元，賣出11,479.2千元。