金門縣警局「組織規程暨編制表」修正案業經縣務會議審議通過，縣警局指出，未來將比照臺灣地區各縣市警察局之組織架構，將現行二級制提升為三級制，第一階段將成立二個分局、刑事警察隊改設為刑事警察大隊，並新設少年警察隊。這項改制將俟縣府發布命令，再報經考試院同意備查後生效，最快在二個月即可展開各項後續作業。

縣警局人事室指出，金門警察單位原僅設保安隊，民國39年1月奉令改為金門軍管區行政公署警察所，民國43年2月省縣體制恢復，金門縣警察所奉令升格，擴編為金門縣警察局，民國45年起始有分駐、派出所，至民國48年分駐、派出所改制為警察所，確立二級體制。其後歷經多次組織修編，至94年7月1日，現有編制員額共計312人。

本縣自81年解除戰地政務，90年實施「小三通」後，1小時航程之便捷海、空運，促使金門已步入臺灣與大陸海峽兩岸間一日生活圈之時代；隨著交通之便捷，各項資訊傳播迅速、出入人員複雜、人權意識高漲及兩岸間頻繁之互動或跨界犯罪等情，使得金門地區之整體治安、交通狀況，在質與量方面均已產生急遽之變化，復以社會犯罪型態日益多元，犯罪手法日趨精進，以目前該局之組織架構，實已無法應付金門地區日益險峻之治安環境。

又為因應政府擬鬆綁兩岸關係，有意將現行金馬之「小三通」擴大為「中三通」，規劃讓設籍在臺灣本島之民眾，亦可循金馬路徑前往中國大陸，但須在金馬地區過夜始能進入中國大陸，以藉此振興金馬離島觀光與經濟發展。而預期上開政策之推展效應，將對現行金門地區交通及治安情勢，造成嚴重衝擊。

因此，為統一警察機關組織制度，健全組織架構與指揮體系，發揮溝通協調效能及嚴密勤務部署，以提昇執法效能、便利為民服務工作，促進良好警民關係，達成警察「依法維持公共秩序，保護社會安全，防止一切危害、促進人民福利」之任務，並因應當前金門地區社會治安狀況、犯罪情勢與未來發展等情事，縣警局在局長林文全的指示與積極奔走下，擬定這項組織編制修正案。

縣警局人事室表示，此次組織編制修正的重點，比照臺灣地區各縣市警察局之組織架構成立分局(金城、金湖分局，由原金城、金湖警察所改設，將現行二級制︻警察局、警察所︼提升為三級制︻警察局、分局、分駐(派出)所︼)、刑事警察大隊(原刑事警察隊改設)、少年警察隊(新增設單位)、訓練科(新增設單位並由原訓練股配合改設提升)、公共關係室(新增設單位並由原公關股配合改設提升)等單位。

本案修正後之預期效益，人事室表示，警局成立上開警察分局等單位後，相關組織制度將與臺灣省各縣市警察局完全接軌，未來除可加強人力資源有效運用，更有助警政人才、經驗之交流，減少區域之歧異，提昇為民服務品質與行政效率，有效打擊犯罪，並能確保金門地區交通、治安之穩定。

另金門港屬國內商港性質，依商港法規定，原應由中央港務警察機關派遣警力執行港務警察工作，惟因時空因素，現由該局設置「金門港警察所」執行上開港務警察工作，維護港區治安任務。經本次組織編制修正後，該局所轄已無「金門港警察所」之單位，除解決長久以來「金門港警察所」之定位爭議，更能立場嚴明、依法有據，要求中央派遣警力或編列警政經費委由該局調派適當警力，執行港區安全維護工作。

縣警局人事室也指出，依「地方制度法」第62條規定略以：「(第2項)縣(市)政府所屬機關及學校之組織規程，由縣(市)政府定之。(第6項)縣(市)政府所屬機關及學校之組織規程，各權責機關於核定或同意後，應函送考試院備查。」爰此，本案為符法制及作業規定，並於縣務會議通過後能順利取得考試院(銓敘部)之備查，經洽銓敘部法規司就法制面等議題會商後，考量「本案礙於「地方制度法」第62條第3項：「縣(市)政府所屬一級機關之一級單位為科。」之規定，該局現行擬成立之訓練科及公共關係室等二單位，因與上開規定未合，為符法制，應俟母法｜「金門縣政府組織自治條例」配合「地方制度法」第62條規定修正，且經考試院核定通過後，始可據以成立。至其餘之分局、刑事警察大隊及少年警察隊等三單位，因無牽涉上開地方制度法之單位名稱規定，自可依法成立。」

因此，本案該局僅先就符合法制規定之分局、刑事警察大隊及少年警察隊等三單位先行成立，至有關訓練科及公共關係室等二單位，將配合金門縣政府及內政部警政署就「地方制度法」第62條規定，分別修正其金門縣政府組織自治條例(金門縣政府)及中央、地方警察機關之警察官職務等階表(內政部警政署)，並報奉考試院核定後，再據以成立，以符法制規定。