第十二任總統副總統選舉，國民黨「馬蕭」在烈嶼鄉獲得壓倒性的勝利，五個村票數都開高，大幅領先對手民進黨「長昌」，「馬蕭」共拿下2897票；「長昌」僅得87票。

烈嶼鄉設有五個投開票所，各地投票進行很順利，民眾前往各投票所行使投票權，大多數選民僅投下總統選票，領取公投票的人不多，領取第五案公投票有三十四人；領取第六案公投票有三十八人。

由於選情激烈，從各地返鄉投票民眾相當踴躍，旅台鄉親就有三百多人專程返鄉投票，而且還都是一家人回家，鄉親說，民進黨執政這八年，台灣經濟蕭條，生活不好過，雖然一家人回鄉投票就要花上萬元以上的機票費，但也是要回來支持心目中的總統副總統候選人。

設籍在烈嶼鄉西宅的旅居汶萊僑領林國欽，只要家鄉有各項選舉，總是專程回家鄉行使投票的權利，這一次也不例外。從汶萊僑居地回家鄉的鄉僑還有林水在等二十多人，還有遠從南非回鄉的洪肇基昆仲，也是為選舉返鄉投票。青岐籍的洪足水一家人在大陸福建經商，也是家鄉有各項選舉，都不會「缺席」。設籍在烈嶼的台商陳榮根、侯貫中等人也是專程回金門投下自己神聖的一票。

金烈的交通船，也滿載著許多居住大金門回烈嶼鄉投票的民眾，旅客量大約比平常假日多。居住大金門的許多烈嶼籍民眾也回鄉投票相當踴躍。金門本地到大陸經商或旅遊的民眾也搭早班船回鄉投下神聖的一票。

這一次總統副總統選舉，烈嶼鄉的總投票率超過五成，為百分之五十點二三，比今年元月的立委總投票率還要高，主要是外地回烈嶼投票人數多，也突顯選民重視這一次總統大選。