地區部分旅行社業者對「試辦小三通相對旅遊」中規定，要接待多少大陸旅客來金，才可相對招攬多少台灣旅客到大陸，認為相當不合理，等於圖利有接大陸團的旅行社，主張應讓市場機制決定。他們也希望公部門出面整合，並擬出配套措施，否則，業者不知道從何著手。

接受訪問的旅行社業者表示，目前許多大陸團來金，不少業者削價競爭，弄壞市場行情，不僅沒賺到錢，還可能損及地區的觀光聲譽，他們及部分旅行社看到價格太低，只會影響觀光品質，都不願接大陸團。但是，「試辦小三通相對旅遊」中卻規定，要接待多少大陸旅客來金，才可相對招攬多少台灣旅客到大陸，這種規定，等於先將他們這些不接大陸團的旅行社淘汰出局，圖利接大陸團的旅行社。

受訪旅行社業者說明，部分接待大陸團的旅行社，因削價競爭，打壞市場行情，也造成大陸團的觀光品質一落千丈，如果「試辦小三通相對旅遊」還規定，要接待多少大陸旅客來金，才可相對招攬多少台灣旅客到大陸，也等於在保障這些削價競爭的業者，對其他堅持品質的業者並不公平，也會影響地區未來的整體旅遊品質。

部分旅行社建議，應該尊重市場機制，取消該規定，如果一天限制只能有六百名台灣客經金門到大陸，可由有需要的地區旅行社採「排班掛號」方式，有需要的才去佔名額，名額滿了，就改等明天的名額。

由於「試辦小三通相對旅遊」可能帶來更多的人潮，已有旅館業醞釀自五月份起調漲房間費，受訪的旅行社業者笑說，還未蒙其利，就要先受其害。

另外，業者對「試辦小三通相對旅遊」到底要如何推動？配套情形為何？都感到「霧煞煞」，因此，也希望公部門出面整合，以免無所適從，也平白糟蹋了可能的發展契機。