金門航空站針對有關最近民眾反映金門─台北航線機位一票難求乙事，金門航空站主任洪念慈表示，自高鐵營運以來，對國內航空業者衝擊甚鉅，航空公司基於營運成本考量，紛紛縮編公司機隊以為因應，造成航空運能降低；復遠東航空公司因財務危機暫停營運，金門─台北航線之疏運能量更形萎縮，再者，暑假旅遊旺季及全面擴大小三通正式實施以來，所衍生之運輸需求等相關因素，機位一票難求實在所難免。

為紓緩金─北航線「一位難求」之窘境，民航局已協調復興、立榮及華信等航空公司，達成增加金門航線運能協議，航空公司亦已自六月下旬起依協議內容調整航班，並加開班機協助疏運。

金門航空站指出，另經統計，各航空公司之金門─台北航線雖常訂位客滿，然實際報到率卻常僅達五至六成左右，顯然有近五成之旅客重複訂位或未搭乘所訂航班，且實際載客率時有達七成之情形。金門航空站呼籲旅客，如旅程已確定時請儘速以電話訂位，亦可多利用各航空公司及相關旅遊網站完成訂位及購票，並請勿重複訂位；如旅客取消時，也請不吝以電話告知航空公司取消訂位，以利其他旅客訂位搭乘。