受廈門市舉辦國際馬拉松賽影響，金門縣港務處表示，明年一月三日的金門和廈門小三通航線客船部分調整，由一天28班船減少為22班，同時廈門航點也作調整，港務處提醒旅客注意1月3日班船時刻表調整訊息，以免行程受影響。
金門縣港務處說，2009年廈門國際馬拉松賽將於明年一月三日上午在廈門國際會展中心鳴槍起跑，廈門市部分主要路段實施交通管制，因此，當天金廈航線航班減少6班船。
金門縣港務處並指出，廈門馬拉松賽比賽當天，由於東渡碼頭附近道路實施交通管制，因此，下午1時30分之前的班船，廈門航點均是改在五通碼頭。
明年元旦假期有四天，不乏民眾選擇小三通到大陸旅遊，金門縣港務處提醒旅客，注意一月三日班船時刻表調整訊息，以免行程受影響。