金門地區之現有自來水管線均係早期埋設，管齡均達三、四十年，總長度高達320公里，由於早期埋設之管線材質均為白鐵管、普通鑄鐵管及PVC塑膠管，其耐蝕、抗壓、水密性均不佳，均難以承受過度交通負荷及超載車輛震動等產生之外力，因而衍生損壞，引致漏水率偏高，造成水資源浪費，且因管線埋設時間長，致管垢蓄積嚴重，常因停水或管壓變化，致使管垢脫落，而造成水質污染，或可能水管緊密度或接合不良，造成水管虹吸現象，倒吸管外污水而使水質污染，影響民眾身體健康，故本縣自來水廠多方籌措財源，積極推動管線汰換工作，以改善用戶用水品質。
水廠表示，金門地區因水資源條件不佳，水源不足，主要利用現有之小型湖庫蓄水供應，然因降雨不均，湖庫容量不足及蒸發量大，且地下水量有限，常不足以應付用水需求，以往每逢旱季經常需實施分區輪流供水以度過難關，造成居民生活極為不便，加上地區管線管齡皆已超出使用年限，以93年度為例，其漏水率高達38％，每年漏水量達298萬噸左右，相當於近二座太湖的蓄水量，若以96年之售水成本每度49.79元計算，一年漏水損失高達1億5千萬元，事態嚴重，值得重視，因此汰換老舊管線及提昇水資源有效利用率，是李縣長主政以來最重要的施政課題。
為汰換老舊管線，水廠逐年配合地區污水管線埋設及鄉村整建進行管網改善計畫，其中自93至97年度合計投資約新台幣2億元，已完工之區域改善長度約為58公里，平均汰換率約為3.66％，已完工之汰換及增設輸配水管區域包括：金城鎮之后豐港、第一期區段徵收（救國團對面）、民生路段、東門至榜林圓環段，及金寧鄉之安岐-林厝段、金技學院段、東坑│湖下段、昔果山水塔│榜林圓環段、埔後段、中山路段、桃園路、金酒金寧廠段、前厝段、嚨口段、金技學院至環島西路段，及金沙鎮之榮湖│洋山路口段、榮湖淨水場│後水頭段、沙青路與五龍山水塔段、田墩│文化園區段、何浦│下塘頭段、高陽路與擎天水庫段、山西│山后段，及金湖鎮之湖前│星宿王朝段、太武山TP16-鑑潭-TP15與太武公墓段、TP15│花崗石醫院段、料羅圓環至柏村國小段、金湖消防分隊│埕下段，烈嶼鄉則完成羅厝碼頭-國家公園段、誠實亭段、直昇機場│大山頂營區等路段之輸配水管線之改善。
而用戶給水管之汰換區域則包括：金城鎮富康一村、金城新莊、古崗、鳳翔社區及安和社區等村落，及金寧鄉古寧頭、榜林及昔果山部分等村落，與金沙鎮英坑、榮光新村、塘頭及田埔等村落，及金湖鎮山外里、溪邊與下湖等村里，烈嶼鄉則完成青岐村、埔頭、羅厝、中墩與后井等村落之給水管線之改善。
另目前水廠刻正配合污水工程及鄉村整建與道路工程，進行烈嶼地區之上林、上庫、楊厝、湖下及后頭，金沙鎮汶沙里、西園、后珩、官澳與青嶼，及金寧鄉盤山村與湖下、后湖等村里之管網改善工程，未來亦將持續進行老舊管線之汰換，以提升供水水質，降低漏水量。
水廠廠長翁自保指出，經統計水廠93至97年度之管線平均年汰換率約為3.66％，已超越國際自來水協會（IWA）的管線的年汰換率1.5％建議值，且較世界各國為高（日本：5.00％、美國：3.50％，德國：1.50％，瑞士：1.45％，西班牙：0.85％，香港：0.20％，台北自來水事業處92年至95年之平均年汰換率約為2.21％，資料來源：北水處網站），另水廠結合其他節約用水措施，已從93年之漏水率38％降低至96年之26.86％，而97年之漏水率亦下降約為24%（台北自來水事業處96年平均漏水率為24.2％，台灣自來水公司95年平均漏水率則為23.45%），漏水量亦從27.28 CMD/km降為14.7CMD/km，平均每年可節省約6千多萬元(以長度300公里及93│96年之平均供水成本44.55元／度計算)，有效改善老舊管線影響供水水質及漏水之問題。
翁自保表示，汰換自來水管線因施工範圍廣，且均需挖掘道路與巷道，對民眾生活的影響很大，並需考量政府財政籌措等許多問題，故必須逐年分區持續執行，以日本東京都為例也是歷經50年管線汰換的改善才將漏水率降至5～7％。但基於地區水源開源不易，且開發成本偏高，因此經李縣長之指示及積極爭取，經建會於日前通過之擴大內需，同意自98年起至100年計三年，每年由水利署補助6000萬元，三年共計1億8000萬元，來辦理地區的老舊管線汰換，水廠也希望地區鄉親在辦理管線汰換工程期間，如果造成大家的不便，希望鄉親多體諒，並給予支持，讓工程順利推動，以有效改善供水品質，並降低漏水量。
水廠也指出，該廠除了持續汰換舊有漏水管線外，亦積極推動相關減漏及節約用水宣導措施，包括持續作全區域的測漏調查工作，更換故障制水閥、更換不精確水錶，並增加流量計，使得所有用水都得以計量，以及增設排泥設施等均可以有效改善供水品質，提高售水率。另由於送配水管線縱橫複雜，為了提昇檢漏之效率，水廠目前亦配合已建置完成之「水質監控系統」及「GIS管網資訊系統」，藉由電腦系統之自動回饋，反應各區之供配水現況，達到使各用戶之用水水量、水壓品質之穩定，並經由系統之分析能即時發覺漏水或破管，減少水資源之浪費，亦能達到降低漏水率之成效。
水廠表示，目前該廠積極進行老舊管線汰換計畫，雖可降低漏水率，並避免用戶端之水質遭受污染，但源頭之湖庫水源，其水量與水質均已無法滿足現法令標準及未來發展所需，因地區目前之傳統淨水程序，無法去除包括現有湖庫之氨氮與氯鹽等重點污染物，但興建高級淨水場與海淡廠其成本極高，且在目前能源價格節節上升之當頭，高級淨水處理與海淡廠並非經濟可行之水源，因此由境外自大陸引水，係解決金門水資源欠缺及湖庫水質不佳的最佳選擇，但由台灣本島引水，祗有船運一途，但每噸運水成本高達700多元，且運送水量有限，並不符成本效益，目前經評估金門自大陸引水於經濟上與技術上均屬可行，未來亦將持續推動，以早日解決地區缺水與原水水質不佳之問題，並達成「夠水、夠淨、夠好」三夠的事業願景，及為消費者提供「貼心、用心、安心」三心保證的好水服務。