高中高職多元入學的管道之一為「申請入學」；今年「申請入學」的簡章將會有一項新規定：錄取考生欲放棄錄取資格者，必須填妥聲明書後，由學生、父母雙方（或監護人）簽章；聲明放棄錄取資格的手續完成後，不得以任何理由撤回。
金門區高中高職申請入學聯合招生將於六月九日、十日報名。金門高中將招收二百三十一名一般生、五名身心障礙生、五名原住民生。金門農工將招收一百八十五名一般生和技優生（技優生佔二十二人；每科兩人）；另外，電機科、商業經營科、電子科、園藝科將各招收一名身心障礙生（四科共四名）；機械科、資訊科、商業經營科、電子科將各招收一名原住民生（四科共四名）。
根據招生委員會的說明，集體購買申請入學簡章及報名表的時間為五月十八日至五月二十二日；招生委員將發函各校調查需求量。
個別購買申請入學簡章及報名表的時間為五月十八日至六月五日－屆時，需要「個人函購」者，可向金門農工註冊組洽購；需要「個人面購」者，屆時可向金門農工、金門高中購買。此外，五月二十一日到六月八日期間，還將會在網路上提供考生自行免費下載。
「申請入學」的報名時間為六月九日（星期二）、十日（星期三）。集體報名是由各國中向主辦學校報名；個別報名則自行要向招生委員會報名。
申請入學的申請對象今年多了一項規定：具申請資格的非本區（金門區）學生，因鄰近地緣關係需越區參加者，得由就讀學校向金門區聯合招生委員會申請。
應屆畢業生向來是採取集體報名，今年亦然；今年為擴大服務，非應屆畢業生也可以於六月八日前回原畢業國中參加集體報名。若集體報名的收件時間已過或原畢業學校無此項服務時，仍可在截止前參加個別報名。
今年的金門區高中高職申請入學聯合招生還有一項新規定，那就是要放棄錄取資格者，聲明書必須要有學生本人、父母雙方（或監護人）的簽章，才具備效力。完成放棄錄取資格手續者，才能參加本學年度其他入學管道。