行政院已核定備查「金馬中長期經濟發展規劃方案」。其中，核復經建會有關金門大橋之興建擬議，認為尚涉及興建時機、工程技術、財務計畫、經費籌措及分攤、後續維護管理等情事，應由相關部會協助金門縣政府研擬相關計畫，循序推動；另其餘相關規劃措施，亦應由相關部會協調金門、連江縣政府研擬計畫辦理。
經建會在「金馬中長期經濟發展規劃方案」中，就金門大橋之效益評估，有關建橋背景介紹指出，金門大橋，連接金門本島與烈嶼，又稱金烈大橋，長度約為五公里，興建經費約四十餘億元（北路廊：由金門本島西岸的「湖下」連結烈嶼東岸的「后頭」），曾於九十年七月二十七日獲行政院政策同意，後因規劃路線之改變，加上考慮交通旅次不高等因素，遲未正式推動。
經建會指出，隨著目前時空環境已大幅轉變，對於金門大橋的興建與否，不應僅考量實際支出的貨幣成本而已，更重要的是關注金門全面性發展的效果，包括社會面及產業發展的影響及效益，以及考量金廈生活圈的利基以及配合開發小金門等效益。
至於對金門地區與產業發展之影響，經建會指出，在平衡區域發展方面，陸運串連大小金門，縮短大小金門差距，有助於小金門開發，並擴大小金門生活圈。而在改善小金門生活水準方面，金門大橋之興建能提供管線附掛，改善水、電、通信質與量，並可提供小金門緊急醫療服務、消防及救災救援。在促進地方觀光發展上，大橋連接大小金門後，將能吸引旅客至小金門觀光，促進小金門高級海岸度假別墅興建，與帶動小金門海上遊憩觀光發展。
有關效益評估方面，經建會指出，依據交通部台灣區國道新建工程局2003年「金門大橋興建計畫綜合規劃報告書」，金門大橋興建工程建造費用約四十四點三六億元，外掛大金門塔山電廠電纜線至小金門之費用約一億元，合計總費用為四十五點三六億元，營運後之每年支出約三千四百萬元。而假設以金門大橋工程完成後營運三十年作為效益分析期間，2009年為工程起始年，2015年為通車年，2044年為評估目標年。可量化的效益包含旅行時間節省、運輸成本節省、運輸可靠度提升效益、管線附掛效益及觀光效益。
根據此計畫成本及以上可量化之計畫效益項目進行之經濟效益評估，評估之計畫淨現值（NPV）為十一點八億元，計畫之內生報酬率（IRR）為百分之六點零三，益本比為一點二八，此三項指標顯示金門大橋興建計畫具經濟可行性。若再納入地價上漲效益，則興建金門大橋計畫之淨現值（NPV）為三十三點五億元，內生報酬率（IRR）為百分之十點七六，益本比為一點八零。（資料來源：經建會委託研究報告，2009，「金馬中長期經濟發展規劃」）。
經建會建議，上述經濟效益評估尚未包含平衡大小金門之發展、保障小金門醫療後送以及就業機會增加等定性效益，若考量前述效益後，經濟效益將再提高。此外，全面大三通已進一步實現，勢將影響金馬地區經濟發展，金門大橋串連大小金門，可將大小金門資源整合，有助於金門未來在金廈生活圈中取得關鍵地位，甚至未來如進行金廈大橋之路線規劃時，亦能因為金門大橋之存在，使規劃方向朝對金門有利的方向進行。
綜上，金門大橋興建實有其必要性、可行性及迫切性，且前已獲政策同意，為彰顯政府積極回應民意，並促進地方經濟，金門大橋應儘速興建。