針對媒體報導「金門空氣含砷量為台北三倍，疑福建工廠污染」，金門空氣受大陸污染，環保署相當重視，已規劃成立「兩岸環保事務合作諮詢顧問小組」，將相關議題及解決方式納入討論及實施，並盼透過兩岸協商及合作機制，有效解決空氣污染長程傳輸問題。
　中研院環境變遷研究中心研究發現金門空氣懸浮微粒較高，報告中指出，懸浮微粒的鐵對鋁質量比值小於平均地殼組成，而與陶瓷廠排放源的特徵比值接近，也與陶瓷業原料黏土礦物的少鐵特性一致；而大陸福建是中國重要建築陶瓷產區之一，根據化學數據及配合氣象條件，陶瓷工廠粉塵逸散，加上燒陶時燃煤產生大量污染性氣體及微粒，可能是金門高懸浮微粒最主要的污染來源。
而本縣環保局也建請環保署透過海基、海協兩會協商管道，尋求解決與改善。
環保署發佈新聞稿指出，由於我國位於大陸空氣污染物長程傳輸的下風區，從長期空氣品質監測資料可以瞭解，來自大陸的空氣污染物，無論是北方沙塵暴揚起的沙塵或沿海的工業污染物，不單是對近距離的金門造成影響，也對台灣本島造成相當顯著的影響。
環保署表示，空氣污染無國界，跨國傳輸的空氣污染物影響已是全球性課題，面對跨境污染問題，日本、韓國與大陸在2000年起，就針對跨境環境污染問題進行研究。
環保署對於空氣污染長程傳輸的問題與影響一向極為重視，從95年起即與美國環保署、美國太空總署及美國海洋大氣總署等國際監測合作，同時於中部海拔2862公尺的鹿林山設置國際級空氣品質背景測站，進行跨區域傳輸觀測。
此外，該署97年於全國8個地點進行監測及採樣結果顯示，空氣中有害物質元素呈現春季高、夏季低，根據氣流軌跡分析顯示，春季可能來自中國大陸沙塵或工業污染與中南半島的生質燃燒長程傳輸影響，而夏季氣流來自於海洋，相對較為乾淨。
由於空氣中重金屬濃度之罹癌風險需透過長期流行病學研究，環保署除將協助相關研究外，為掌握空氣污染物之跨境傳輸及影響，並參考國際作法及以往經驗，將於規劃成立之「兩岸環保事務合作諮詢顧問小組」運作機制下，針對大陸沙塵暴及沿海之工業污染物長程傳輸影響我國空氣品質之問題進行研討，並透過兩岸合作機制，解決空氣污染相關問題。