針對莫拉克颱風侵襲，造成台灣中南部、東部地區受創嚴重，因應消費者因受莫拉克颱風影響取消行程，衍生退費問題，交通部觀光局已於八月十日與旅行業全聯會及品保協會洽商旅客取消行程之處理方式，以維護消費者權益。
交通部觀光局與旅行業全聯會及品保協會洽商旅客取消行程之處理方式，決定其處理原則如下：即旅遊行程因受莫拉克颱風影響致無法成行，或旅客居住地在災區，或旅遊地區為災區者，係屬不可抗力之事由，旅客取消行程時，如其為國外旅遊者，適用國外旅遊定型化契約第二十八條規定；如其為國內旅遊者，適用國內旅遊定型化契約第二十條規定處理，即旅行業於扣除已代繳之規費及必要費用後，應將餘款退還旅客。另旅客如欲延後出發者，亦得與旅行業洽商處理。
金門縣政府消費者服務中心指出，觀光局提醒旅客如與旅行社有消費爭議而無法解決時，得向該局（地址：台北市忠孝東路4段290號9樓，免費申訴電話：0800211734）或品保協會（地址：台北市長安東路2段78號11樓，電話：25068185）申訴個案調處。
另為保障旅客訂房之權益，觀光局業已擬訂「觀光旅館業、旅館業及民宿旅客直接訂房定型化契約範本（草案）」送行政院消費者保護委員會審議。在該定型化契約範本審議通過前，為保障消費者權益，觀光局前已函各觀光旅館業、旅館業及民宿經營者等，於接受消費者訂房時，應充分揭露消費資訊，將訂房及取消訂房之程序等內容（包括房價、房型、取消或變更訂房是否收費等）明確告知消費者，且規定內容應合理。
另對於受莫拉克颱風影響而取消訂房之情形，觀光局已函請相關業者退還旅客所繳費用，旅客如與業者有消費爭議而無法解決時，可向當地縣市政府提出申訴主張合理權益。