中央選舉委員會九月四日經公告，年底縣市長、縣議員選舉之種類、名額、選舉區之劃分、投票日期、投票起、止時間及競選經費最高金額等事項。其中，金門縣第五屆縣長選舉，應選名額一名，競選經費最高金額為三千一百二十五萬三千元。
而金門縣第五屆縣議員選舉，議員總額為十九名（均為區域議員），其中，第一選舉區（金城鎮、金寧鄉、烈嶼鄉、烏坵鄉）應選名額十二名，應選名額中應有三名婦女當選名額；競選經費最高金額為六百零九萬八千元。第二選舉區（金湖鎮、金沙鎮）應選名額七名，應選名額中應有一名婦女當選名額；而競選經費最高金額為六百一十萬二千元。
中央選舉委員會經公告臺灣省各縣（市）第十六屆（新竹市、嘉義市第八屆）縣（市）長、福建省金門縣、連江縣第五屆縣長選舉，以及公告臺灣省各縣（市）議會第十七屆（新竹市、嘉義市第八屆）縣（市）議員、福建省金門縣、連江縣第五屆縣議員選舉之種類、名額、選舉區之劃分、投票日期、投票起、止時間及競選經費最高金額等事項。
在投票日期方面，均為九十八年十二月五日，投票起、止時間為上午八時至下午五時止。
中央選舉委員並指出，行政院已核定改制或與其他直轄市、縣（市）合併改制為直轄市之台北縣、台中縣、台南縣、高雄縣、台中市、台南市，依法不辦理改選。