金門縣政府教育局依據教育部因應H1N1新型流感國中小及幼稚園停課與課業學習相關措施，訂定「金門縣各國民中、小學（含幼稚園）因應H1N1新型流感居家學習計畫及補課措施」，以為因應。
　縣府教育局經訂定的「金門縣各國民中、小學（含幼稚園）因應H1N1新型流感居家學習計畫及補課措施」，有關學校因應H1N1新型流感停課，恢復上課後應補足停課期間之課業進度，其補課可依下列原則辦理：（一）每天正常上課後之課後時間辦理補課。（二）利用週休二日辦理補課。（三）國小利用週三下午辦理補課。（四）利用寒暑假辦理補課。（五）其他可辦理補課時間。
　而學校停課期間，應鼓勵學生利用下列網站進行居家線上學習：（一）教育部國民中小學學習資源網（網址：http://siro.moe.edu.tw/）。（二）六大學習（http://learning.edu.tw/sixnet/）。（三）學習加油（http://content1.deu.tw/）。（四）國立教育資料館（http://www.nioerar.edu.tw/）。（五）金門縣教育局首頁訊息公告自學網之教學多媒體相關網站連結。
　至於疫情第五級（含）以上需全國停課時，配合教育部及縣府教育局辦理疫情控制及學生學習相關措施，並利用國立教育廣播電台（電話：02-23880600轉220節目組）之頻道接收或傳遞相關資訊。
　而學校因疫情需停課，於學生離校前，應囑咐學生下列事項：（一）請學生每日自行測量體溫，注意是否有不適症狀，並宣導儘量避免至公共場所，做好自主健康管理。（二）教師應為學生規劃停課期間學生在家自主學習之進度，或其他學習活動。（三）停課期間導師每日應與學生保持聯繫，以了解學生身心健康及居家學習情形。（四）學校輔導室應主動提供學生心理支持，並就居家隔離（學習）學生個案需要，進行所需之學生輔導、諮詢、轉介或提供其他適當之專業服務。
　而學校應建立妥適之聯繫通報管道，遇停課期間，每日應充分掌握學生狀況，並依規定通報。學校停課期間，行政人員原則上應照常上班，以利行政運作及相關資訊之掌握，如有特殊情形，縣府教育局另行彈性決定是否停止上班。若教師出現類流感症狀，無法到校上課，請學校妥善因應師資人力調配事宜。
　教育局指出，為避免感染，應確實向學生宣導下列事項：（一）避免前往H1N1新型流感發生地區。（二）注意個人衛生及保健：勤洗手，養成良好衛生習慣。（三）注意呼吸道衛生及咳嗽禮節：1、有咳嗽等呼吸道症狀時應戴口罩，當口罩沾到口鼻分泌物時，應立即更換並丟進垃圾桶。2、打噴嚏時，應用面紙或手帕遮住口鼻，若無面紙或手帕時，可用衣袖代替。3、如有呼吸道症狀，與他人交談時，儘可能保持2 公尺以上距離。4、手部接觸到呼吸道分泌物時，要立即澈底清潔雙手。5、生病時應在家休息，除就醫外，儘量避免外出。
　而如果有類似H1N1新型流感的症狀，應立即戴口罩，通報當地衛生局協助就醫，並主動告知醫師症狀及旅遊史。