金門縣衛生局長陳天順在縣府主管會報中報告有關H1N1流感疫苗施打情形時，是鼓勵民眾施打。該局也將持續加強宣導疫苗對疾病的保護效力，以及持續加強校園疾病防制輔導與宣導作為。
陳天順指出，H1N1流感疫苗，金門縣預計分配四萬零五百劑疫苗，目前已撥領三萬七千八百劑，截至九十八年十二月二十八日，金門縣共計施打一萬三千八百一十三人，其中成人一萬一千九百四十六人（含學生七千九百四十六人）、幼兒一千八百六十七人。
　他指出，金門縣H1N1流感疫苗校園接種率達八成以上，有關國小一至三年級第二劑疫苗接種率，因受媒體報導疫苗副作用事件，接種意願些微下降近二成。衛生局將持續加強宣導疫苗對疾病的保護效力，期學童獲得足夠的免疫能力。
　另外，十二月二十七日金門醫院通報一例一歲三個月，疑似流感合併重症個案，並已採集相關檢體送疾病管制局合約實驗室再進一步檢驗，目前病童病況尚穩定。
　陳天順指出，十二月二十九日金門醫院通報一例境外移入登革熱病例，病況尚穩定，該局已進行疫情調查及相關處置。有關金門縣幼兒腸病毒疫情，九十八學年度上學期截至九十八年十二月二十九日止，陸續通報幼童感染腸病毒計三十八人，其中三十六人已痊癒返校，二人持續追蹤中。通報的學園包括金城幼稚園二十八人、開瑄國小附設幼稚園四人、金寧中小學附設幼稚園一人、何浦國小五人；本學期迄今停課共計九班二百三十四人，至九十八年十二月三十日止已全數返校上課。衛生局將持續加強校園疾病防制輔導與宣導作為。