日前於澎湖縣發生之口蹄疫案例，引起縣府關切，縣長李沃士擔心是否會波及金門。為此，金門縣動植物防疫所表示，金門地區口蹄疫防疫及牧場自衛防疫現況良好。
金門縣動植物防疫所所長莊謙恭指出，二十二日發生於澎湖縣之口蹄疫案例，經行政院農業委員會家畜衛生試驗所鑑定，確認為O-Taiwan株，僅感染豬隻，不會感染反芻動物。又澎湖自九十六年四月一日起，所有偶蹄類家畜即停打口蹄疫疫苗，以致豬隻沒有抗體，該感染場九百九十九頭均以撲殺。
就地區防疫作為及牧場自衛防疫狀況，莊謙恭也表示，目前地區養豬戶均配合各鄉鎮公所公務獸醫師依「清除豬瘟暨口蹄疫所需疫苗之種類及其管理辦法」執行免費豬隻防疫注射。草食家畜則由防疫所派員實施，一般抗體力價表現良好，未曾發現口蹄疫非結構性蛋白，且地區於九十六年十一月至九十七年曾針對白肉豬全面停打疫苗亦無異常發現，證明地區沒有野外毒；防疫所也免費提供養殖戶所需之消毒藥水，每週派員巡迴重點場消毒，目前地區口蹄疫防疫及牧場自衛防疫現況良好。
預防口蹄疫情自外地傳入，金門縣動植物防疫所呼籲金門偶蹄類動物畜牧場，應加強生物安全措施，每週實施全場消毒；避免病毒可藉生物性媒介物及人媒介而傳播，相關人員平時應做好衛生清潔及安全防護措施。防止口蹄疫自疫區國家傳入，也敬請畜牧從業相關人員應避免前往疫區國家及大陸畜牧場參訪，並應停止外來人士進入畜牧場。