金門區100學年度高中及高職聯合申請入學將於六月七日（星期二）、六月八日（星期三）報名。　透過「申請入學」的管道，今年國立金門高級中學將招收普通科學生一百三十四人；國立金門農工將招收八十八人。
　金門高中「申請入學」的招生名額如下：一般生128人、身心障礙生3人、原住民生3人；合計134人。
金門高中的錄取標準如：依「100年第一次國民中學學生基本學力測驗分數加權後之總分（含寫作測驗）」加「特別條件加分分數」後之總成績高低排序錄取。總分相同時，參酌順序為：寫作測驗、國文科、數學科、英語科、社會科、自然科。
　金門農工「申請入學」的招生名額如下：機械科、汽車科、電機科、家政科、漁業科、水產養殖科、資訊科、商業經營科、電子科、園藝科、餐飲管理科各錄取一般生6人、技優生2人；以上十一科共將錄取88人。
　金門農工的錄取標準如下：除技優生外，其他身份學生依100年第1次國民中學學生基本學力測驗分數之總分高低排序錄取。總分相同時，參酌順序為寫作測驗、國文科、數學科、英語科、社會科、自然科。
　技優生總積分核算方式，另加技藝技能得分，若有同分情形，依「技藝技能得分」高低順序分發。
　金門農工另有身心障礙生及原住民生名額；凡符合特殊身分學生且達一般生錄取標準之名額，係以外加方式錄取，且各類錄取名額以2名為限；各科最多1名。
　根據承辦學校國立金門高級農工職業學校公布的訊息，集體報名是由各國中向承辦學校報名。申請入學重要日程表如下：
　六月七日（星期二）、八日（星期三）－聯合申請入學報名。
　六月十日（星期五）－各高中高職學校領回報名資料。
　六月十五日（星期三）－各高中高職學校申請入學放榜。
　六月十七日（星期五）－錄取學生赴各錄取高中高職學校報到。
　六月二十一日（星期二）以前－申請入學結果複查。
　六月二十四日（星期五）以前－已報到學生聲明放棄錄取資格。
　六月二十七日（星期一）以前－申訴。
　六月三十日（星期四）－各高中高職學校傳真已報到名單至各國中。
　七月一日（星期五）－各高中高職學校彙報學生錄取及報到名冊至各區聯合申請入學委員會。