金門縣的養牛頭數已由兩年前的三千多頭，增加至目前的約四千九百頭；因此，斃死牛的處理成為首要必須解決問題。
　 金門縣動植物防疫所昨天召開「100年度年終工作檢討會」，所長莊謙恭表示：斃死牛的處理，在金門因為「化製」根本不可行，掩埋又絕非長久之計，未來擬採「菌體有機廢棄物處理機」及「新建焚化爐」雙軌作業，希望能在四月份前完成所有的評估及規劃。
　 斃死牛的處理，在「金門縣動植物防疫所100年度年終工作檢討會」中，被列入「重要工作執行情形」進行報告。
　 根據防疫所的報告，金門地區自九十九年迄今已辦理活牛銷台四百四十二頭，有效帶動養牛產業發展及經濟收益。
不過，近兩年來，金門地區的養牛頭數已由三千多頭發展至近四千九百頭；因此，斃死牛處理方式已成為首要待解決問題。
　 由於防疫所既有焚化爐無法容納大型牛隻，為了減少病死畜棄置掩埋所造成環境污染，目前是暫依金門縣府「動物屍體清運標準作業程序」，運送至新塘垃圾場掩埋。若以長遠畜牧產業發展考量，仍以焚化爐焚燬為最佳處置方式。目前執行的進度及未來規劃期程如下：
　 一、有關斃死牛隻以「建置肢解設備」、「設置化製廠」及「以冷凍櫃集中運至臺灣化製」等處理方式，經評估後，確定難以處理；防疫所已經將結果函報金門縣政府備查。
　 二、因為受限於環保相關法規，防疫所現有焚化的設置已達到每小時四百公斤的最大容量，無法再增設新焚化爐；且因臨近福田家園及長照中心，雖然排放量的檢測均符合環保法規，但預期未來必然會面臨責難，若欲汰舊換新，設置牛隻焚化爐，必須深思熟慮。
　 三、為協助養牛戶解決斃死畜處理事宜，防疫所已經初步估價裝有吊車，可處理牛隻的二百五十公斤焚化爐一台（容量超過者設計圖必須送審），需款計一仟六佰萬元整（不含廠房）；將專案評估設置於畜產試驗所的野放鹿園後側及屠牛線周邊。
　 四、台灣現今較具規模的養豬場，一般會自行設置有機廢棄物高速處理機，其原理是先分切絞碎後再加入有機菌體（酵素）及乾料或木屑加以分解。一頭一百公斤的豬隻，約兩天可完全分解；發酵完成的殘渣可再利用當做肥料。防疫所已向綠泰生物科技公司訪價－適用於牛隻的畜牧場菌體有機廢棄物高速處理機（容量四噸）一台需款新台幣三佰六十萬元，螺旋出料機一台計六萬元整；共計三佰六十六萬元整，但目前未有牛場購置，實際操作效果未知。
　 五、由於除了「化製」外，都無處理斃死牛的妥善機械設備；防疫所將於一零一年春節過後派員赴臺觀摩現有機組的運作現況，並將赴嘉義大學評估防檢局已購置兩年的絞碎機是否能妥當運作；於赴臺觀摩之後，將會再提專案評估報告；預計一零二年可完成設置及運作。
　 對於斃死牛的處理，莊謙恭決定採「菌體有機廢棄物處理機」及「新建焚化爐」雙軌作業，並希望能在四月份前完成所有的評估及規劃。
　 列席檢討會的金門縣政府建設局專員楊文璽則表示，金門地區養牛的規模會越來越大，希望防疫所對雙軌作業要能詳細評估；如果無法達到要求就不大好！