金門縣衛生局對秋節相關產品進行抽驗，被抽檢的一百一十六件檢體中，只有聖祖貢糖所用的芋頭餡含「己二烯酸」1.388ppm，不合格；聖祖貢糖的負責人透過友人說明，不合格的餡料並未被用於產品。
含有「己二烯酸」的芋頭餡，其製造廠商為新北市德麥食品股份有限公司；金門縣衛生局表示已經依規定銷毀，並於九月二十四日以「衛藥字第1010010555號函」移請新北市政府衛生局裁處。除了芋頭餡檢驗不合格（抽驗時間為八月二十二日）外，聖祖的烏豆沙、棗泥餡、綠豆沙、蓮蓉餡都被檢驗合格（抽驗時間為八月二十二日）；台式香芋月餅、焦糖栗子月餅、鳳梨酥月餅也被檢驗合格（抽驗時間為九月十七日）。
金門縣衛生局於八、九月針對月餅、內餡、烤肉食品物品進行抽驗，共採驗一百一十六件檢體－包括月餅25件、內餡31件、烤肉相關產品38件、肉製產品22件。
檢驗項目包括防腐劑、人工甘味劑、大腸桿菌、大腸桿菌群等，檢驗結果有1件月餅餡料芋泥餡含防腐劑未符合食品添加物使用範圍及限量衛生標準，其餘均符合規定。
八月二十二日抽驗合格的產品如下：果子工坊烘焙坊山外店的芋頭餡、紅豆餡、奶酥。麥斯麵包的鳳梨餡、烏豆沙、紅豆沙。我家食品廠的紅豆餡、藍莓、奶酥。一家人麵包店的龍眼肉、芋頭餡、紅豆餡。佳軒西點麵包坊的地瓜餡、烏豆餡、芋頭餡。展悅西點麵包坊的鳳梨椰果、藍莓、烏豆沙。一來順的鳳梨椰果、紅豆奶油。金口福食品有限公司的黃金薯、芋頭餡、山藥酥。維都西點麵包店的葡萄乾、烏豆沙、肉鬆。
九月十七日抽驗合格的產品如下：佳軒西點麵包坊的白蓮蓉月餅、香菇魯肉月餅、烏豆沙月餅、土鳳梨酥。展悅西點麵包坊的栗子月餅、綠豆沙蛋黃酥。金口福食品有限公司的蓮蓉月餅、烏豆沙月餅、鳳梨月餅。維都西點麵包店的綠豆椪。一來順的栗子月餅、紅豆燒月餅、鳳梨酥月餅。麥斯麵包的烏豆沙月餅、綠豆沙月餅、鳳梨月餅。東京蛋糕屋的綠茶月餅、草莓酥、哈密瓜酥。果子工坊烘焙坊山外店的綠豆椪、卡布奇諾月餅、香菇干貝月餅。
九月四日抽驗合格的產品如下：金門牧場的黑胡椒牛肉乾、原味牛肉乾。高坑有限公司的原味牛肉乾、高粱原味牛肉角。永群高粱黑豬肉專賣店的原味牛肉乾、辣味牛肉乾。老農莊食品商行的辣味牛肉乾、蜜汁牛肉乾。鑫寶島的戰地肉乾、戰地牛肉乾。良金牧場的原味高粱牛肉乾、辣味高粱牛肉乾。喬安牧場食品股份有限公司的原味肉紙、高粱原味牛肉乾。一來順的原味牛肉乾、原味豬肉乾。洪師父金饌股份有限公司的黑胡椒牛肉乾、原味牛肉乾。金佳旺食品有限公司的麻辣牛肉乾、紅麴牛肉乾。金門興茸觀光牧場的原味高粱鹿肉乾、黑胡椒高粱鹿肉乾。