「第三期（一百至一百零三年）離島綜合建設實施方案」刻正推動中。根據行政院經建會指出，離島建設基金於九十至一百年間，補助計畫之總經費計二百二十四億元。補助金額以澎湖縣最多、金門縣居次、連江縣第三。
　經建會指出，我國自八十九年實施「離島建設條例」，並自九十年起分十年編列三百億元成立「離島建設基金」，推動離島各項建設。截至九十九年底，基金額度三百億元已全數編足，完成之補助計畫超過一千項，經建會爰對離島建設計畫進行總檢討，一方面檢視過去十年來之執行成果與效益，一方面探討基金永續運用之模式，作為未來繼續推動離島建設之政策參考。
　經建會指出，離島建設基金於九十至一百年間，補助計畫之總經費計二百二十四億元。補助金額以澎湖縣最多、金門縣居次、連江縣第三；計畫類別以基礎建設占一百零七億為最大，其次依序為地方特色產業之輔導（二十四點三億）、水資源及能源開發（二十三點八億）、離島交通補助（十九點五億）、生態與環境維護（十八點四億）等。
　經建會並指出，十年來離島基礎民生設施，包括自來水普及率，垃圾回收率，醫療衛生服務等均有顯著之改善；另離島居民對外之交通，藉由補助購置島際間交通船，以及居民之交通費補貼，使得離島居民交通費占可支配所得之比率（百分之四點四至百分之五點四）遠低於全國平均值（百分之七點八）；至於最重要之觀光產業，經過十年來相關遊憩設施、特色景點及文化創意之投資，吸引了大批觀光客前往離島旅遊，其中，金門縣觀光旅客人次近十年來約成長三倍、連江縣約成長二倍，澎湖縣亦成長近六成，去（一百）年分別達到一百一十六點三萬人次、九點八萬人次與六十六點六萬人次。
　經建會表示，展望未來，「第三期（一百至一百零三年）離島綜合建設實施方案」刻正推動中，各離島均以發展樂活觀光為共同目標，該會當本於國家整體發展，強化離島之角色定位，持續推動離島公共建設，提升競爭力，發展地方特色產業，將離島建設為深具文化風采與美景天成之綠色島嶼。