2013金門馬拉松賽明年1月20日舉行，競賽組報名1700名額大爆滿，出現「秒殺」盛況，造成愛好路跑者向隅。金門縣政府教育局正研議中，可能會增加一定名額給金門鄉親參加全馬或半馬競賽。
縣府教育局指出，競賽組報名的名額限制，主要是考量金門交通與住宿條件，12／5日受理線上報名，當天即湧入7500多人上網報名，且當天下午3時左右1700個名額就額滿了。也讓許多未順利完成報名的在地金門鄉親感到很失望。
縣府教育局在競賽組報名第2天就接到很多電話抱怨，如一個團隊60人中有半數完成11.2公里路跑組報名，另半數未完成繳費而無法報名。還有澳門路跑選手等也未能如願，頗感遺憾。
縣府教育局表示，將考量金門交通、住宿等問題後，增加全馬、半馬一定名額給金門鄉親，以及台灣去年全馬前五名(男子組)、前三名(女子組)。半馬男女子組前三名、曾連續參加金門全馬五年的選手。均列為考量對象。
金門馬拉松分為全程馬拉松42.195公里、半程馬拉松21.0975公里、11.2公里路跑組及5公里休閒組。休閒組在比賽當天前受理報名。縣府教育局鼓勵大家踴躍報名休閒組，一起來路跑健身。