為了營造無菸校園及優質公廁，金門農工正在推動學校優質校園公廁競賽；月平均評分達90分以上的廁所，負責維護的學生，最高可被記嘉獎兩次。
根據新制定的〈國立金門高級農工職業學校優質校園公廁競賽辦法〉；比賽的評比項目包括：一、菸蒂根數—佔20%。二、異味—佔20%。三、清潔—佔20%。四、硬體設備—佔20%。五、美觀標語—佔20%。每週每日將由評分人員進行不定時評分，每月都會結算平均分數。
獎懲標準如下：
一、月平均達90分以上者，各班參與打掃維護同學最高可獲記嘉獎2次。
二、月平均達85分以上，90分以下者，各班參與打掃維護的同學最高可獲記嘉獎1次。
三、、月平均分數未達80分者，於每月最後一天時，全班將被留校加強打掃。
四、每學期月平均分數依次評比出前四名，分別頒予獎金（禮券）4000元、3000元、2000元、1000元。
五、每學期獲獎班級的導師將獲敘獎並列為「績優導師」的重要參考依據。
六、每學期月平均分數有2次或2次以上得最後一名者，參與打掃及維護的同學將被記警告1至2次。
廁所清潔的重點包括：
一、大小便池—儲水池周圍及底部不可有黃垢、便垢，馬桶內外均要刷洗乾淨。
二、牆面—廁所內外的牆面均要刷洗，不可有污垢、膠帶。
三、鏡子—維持明淨光亮。
四、地板—需清洗乾淨，不可積水，出水口不可堵塞。
五、洗手台—內外均要刷洗，下方不能有沙子、垃圾和蜘蛛網。
六、窗戶—窗台、窗框、玻璃均須擦拭。
七、垃圾—垃圾桶須保持乾淨，每天要清理垃圾。
硬體設備的維護重點如下：
一、工具室—掃具須排放整齊。
二、設備—廁所門、大小便池須可正常使用。
三、廁所牆壁油漆髒污者，應至總務處領取油漆復原。
四、天花板要保持無損。
金門農工辦理學校優質校園公廁競賽的目的包括：
一、美化校園環境，加強生活教育，使學生養成良好的衛生習慣。
二、做好廁所整潔維護，提升如廁文化及水準，共同提升環境品質。
三、引導學生了解廁所的正確使用方式及愛物惜物及無菸校園的理念，確實將教育落實於生活中，並融入「服務學習」的觀念。